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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002315`

染色体: Chr06 坐标: 33408187-33411391 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002315`
名称	SmilChr06G002315
描述	uncharacterized SmilChr06G002315
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	33408187 - 33411391 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989148`
GeneID	`130989148`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989148`
原始查询	`SmilChr06G002315`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989148

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769067.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769068.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057769068.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057769068.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769069.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:33408637`	`AGC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B128,B74
`Chr6:33408761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B63,C53
`Chr6:33408777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr6:33408792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,B98,C50
`Chr6:33408816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B77
`Chr6:33408822`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B66,B8
`Chr6:33408822`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr6:33408852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B124,B47,B67,B83,B9,C33,C48,C79,C85
`Chr6:33408856`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr6:33408856`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr6:33409199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A4,A9,B101,B126,B20,B23,B47,B55,B71,B93,C12,C47,C58,D6
`Chr6:33409286`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	31	A24,B111,B119,B129,B132,B134,B135,B17,B3,B34,B54,B61,B77,B89,B9,B91,B95,B97,C10,C15,C20,C29,C3,C30,C33,C42,C50,C52,C87,D2,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769067.1

123 aa

123

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 17-96 aa

XP_057769068.1

115 aa

115

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 17-88 aa

XP_057769069.1

111 aa

111

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 6-84 aa

XP_057769070.1

111 aa

111

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 6-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769067.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	17	96	0.00019	22.1	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057769068.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	17	88	0.00038	21.1	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057769069.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	6	84	0.00018	22.1	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057769070.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	6	84	0.00018	22.1	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090506.1
GTTTCCTTTTCCTCTTTCAATTCATTCTAAAGTCCGGTGCCGCTACACTGAAATTGGGTGAGCCGGCGCTGCCGTAGTTTCTCTAAATCCGACACAATCGTCGTTCGTTTCCTCTTCTTCTCTCAATCACTACAATTCCAGAGTCCACACACAAAGAATCGAGCCCTAGTTCATTATTCTCTTGGAAACTGTTGCCGTCGCGGCTCCTCTCCGACGATGTTGTGCCCGCCGTCGGCGTTGCCTCTAGTGTTCTCAATTAC...

XM_057913087.1
TTTCCTTTTCCTCTTTCAATTCATTCTAAAGTCCGGTGCCGCTACACTGAAATTGGGTGAGCCGGCGCTGCCGTAGTTTCTCTAAATCCGACACAATCGTCGTTCGTTTCCTCTTCTTCTCTCAATCACTACAATTCCAGAGTCCACACACAAAGAATCGAGCCCTAGTTCATTATTCTCTTGGAAACTGTTGCCGTCGCGGCTCCTCTCCGACGATGTTGTGCCCGCCGTCGGCGTTGCCTCTAGTGTTCTCAATTACA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130989148
ATGATTTCATTCTGGTGCAGGTCTGATGGAACCAAAATGATAGTGCATATGTTCGACTCTCTTTATAATAGAATTCGTGATGTCCCTTGGAAAGCTGCTGTTGACAATGCTATGAGTATCTACAATGCAAACAAAGGAAAGAAATTCAAGAACTCGGCAAAATGGGAAAATATAAAGGCTCCTAAGCAACCTGGTGGTACGGAATGTGGATTTTTTGTGATGCGCTATATGAAAGAAATAGTGCAAGGGTTTGAAAAGGA...

LOC130989148
ATGATAGTGCATATGTTCGACTCTCTTTATAATAGAATTCGTGATGTCCCTTGGAAAGCTGCTGTTGACAATGCTATGAGTATCTACAATGCAAACAAAGGAAAGAAATTCAAGAACTCGGCAAAATGGGAAAATATAAAGGCTCCTAAGCAACCTGGTGGTACGGAATGTGGATTTTTTGTGATGCGCTATATGAAAGAAATAGTGCAAGGGTTTGAAAAGGACGCCAATATTTCTCTGCCATCATTGTTTACGAATGT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057769067.1
MISFWCRSDGTKMIVHMFDSLYNRIRDVPWKAAVDNAMSIYNANKGKKFKNSAKWENIKAPKQPGGTECGFFVMRYMKEIVQGFEKDANISLPSLFTNVQYSQVEIDEVREEWAKCVLTHVLD

XP_057769068.1
MISFWCRSDGTKMIVHMFDSLYNRIRDVPWKAAVDNAMSIYNANKGKKFKNSAKWENIKAPKQPGGTECGFFVMRYMKEIVQGFEKDANISLPSLLNAYKYILSYFNVTFFINYT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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