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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002325`

染色体: Chr06 坐标: 33640370-33640708 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002325`
名称	SmilChr06G002325
描述	uncharacterized SmilChr06G002325
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	33640370 - 33640708 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990787`
GeneID	`130990787`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990787`
原始查询	`SmilChr06G002325`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990787

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771004.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771004.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771004.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771004.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771004.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:33640402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C43,D10
`Chr6:33640414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B136,C33
`Chr6:33640421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B60,C31
`Chr6:33640465`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A1,A22,B108,B117,B132,B134,B2,B29,B4,B42,B52,B70,B99,C1,C15,C23,C28,C34,C37,C50,C61,C63,C75,D11,D5,D9
`Chr6:33640492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:33640497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A3,B101,B12,B137,B32,B55,B61,B66,B98,C16,C17,C2,C32,C46,C47,C52,C68,C86
`Chr6:33640536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C45
`Chr6:33640540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A3,B127,B129,B14,C32,C64,C68,C73
`Chr6:33640543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B44,C79
`Chr6:33640561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A22,A3,B104,B111,B127,B129,B132,B134,B14,B39,B74,C10,C31,C32,C58,C61,C64,C68,C73,D6
`Chr6:33640592`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	B107,B11,B113,B121,B124,B128,B35,B45,B5,B51,B64,B66,B76,B78,C1,C16,C31,C72,D8
`Chr6:33640594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B109,B9,C23,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771004.1

112 aa

112

DUF8803

PF31073 DUF8803 36-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771004.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	36	96	6.3e-08	33.1	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915021.1
ATGTTGACGGAGTTGGATGAGTGGAGAAATGAAGCGTATGAGAGTTCCCGTATCTACAAGGAAAGGGCGAAGAAGTTCCATGATTTGAACATTCGCACAAAGGAATTTAAGCCGGGACATGAAGTACTCTTGTATGATTCTAAGCTTCGACTTTTTCCTGGCAAGCTGCAGTCTAGATGGAGAGGTCCATATGTGGTTCACAAGAGCAATTGGATTGGGACTTATGAGTTGCTTGCATCGAATGGGTCCACTTTCACTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990787
ATGTTGACGGAGTTGGATGAGTGGAGAAATGAAGCGTATGAGAGTTCCCGTATCTACAAGGAAAGGGCGAAGAAGTTCCATGATTTGAACATTCGCACAAAGGAATTTAAGCCGGGACATGAAGTACTCTTGTATGATTCTAAGCTTCGACTTTTTCCTGGCAAGCTGCAGTCTAGATGGAGAGGTCCATATGTGGTTCACAAGAGCAATTGGATTGGGACTTATGAGTTGCTTGCATCGAATGGGTCCACTTTCACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771004.1
MLTELDEWRNEAYESSRIYKERAKKFHDLNIRTKEFKPGHEVLLYDSKLRLFPGKLQSRWRGPYVVHKSNWIGTYELLASNGSTFTVNGHRLKPYFKAELDHDVEVVNFIDP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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