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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002326`

染色体: Chr06 坐标: 33657960-33660529 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002326`
名称	SmilChr06G002326
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	33657960 - 33660529 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990788`
GeneID	`130990788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990788`
原始查询	`SmilChr06G002326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=27.9; qcov=0.567; evalue=9.85e-53; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=36.5; qcov=0.562; evalue=2.24e-74; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771005.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771005.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771005.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771005.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771005.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:33658117`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A1,A18,A3,B100,B118,B125,B129,B13,B131,B140,B20,B33,B34,B36,B40,B43,B47,B64,B73,B78,B8,B82,C24,C26,C3,C32,C38,C40,C45,C48,C5,C55,C60,C65,D2,D4
`Chr6:33658120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B66,B98,C16,C52
`Chr6:33658127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B2,B81,C67
`Chr6:33658324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:33658344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:33658360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B29,B3,B67
`Chr6:33658361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr6:33658373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D11
`Chr6:33658380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B29,B3,B67
`Chr6:33658395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B72,B91,C15,D8
`Chr6:33658404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B77
`Chr6:33658543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B63,B83,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771005.1

633 aa

316

633

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 14-103 aa PF10551 MULE 20-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771005.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	14	103	4e-07	30.7	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057771005.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	20	114	1.3e-27	96.7	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915022.1
ATGAATTTTTTCTTCAGAGACTCTCGCAGCTCTTTGGATTACGATTATTTCGGAGATGTGTTGTCTGTAGATAGTACATATCAGACCAACAAATACAAGCTTGTTTGTGTTCCTTTTATTGGTGTGAACCATCATTTGAAGAATGTTATGTTTGGAATTGGTTTCCTATCTGATGAAACCACCCGATCTTACGAATGGTTACTTTTCACTTTCTTGGAGTCTATGCATTCGAAACAACCGGACATAATTTTTACGGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990788
ATGAATTTTTTCTTCAGAGACTCTCGCAGCTCTTTGGATTACGATTATTTCGGAGATGTGTTGTCTGTAGATAGTACATATCAGACCAACAAATACAAGCTTGTTTGTGTTCCTTTTATTGGTGTGAACCATCATTTGAAGAATGTTATGTTTGGAATTGGTTTCCTATCTGATGAAACCACCCGATCTTACGAATGGTTACTTTTCACTTTCTTGGAGTCTATGCATTCGAAACAACCGGACATAATTTTTACGGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771005.1
MNFFFRDSRSSLDYDYFGDVLSVDSTYQTNKYKLVCVPFIGVNHHLKNVMFGIGFLSDETTRSYEWLLFTFLESMHSKQPDIIFTDQCQSLMDAIDSVFPRASHRLCQWHINQNAPSHFGKLNGNSLFKKAWFHYMNGCDTEDEFELTWMCMIDEYGLAQNRWFNTMYGLKKRWSSVFTNQQFCTGLHVTSRSEVTNKVIKNLCSANISLHDFVLKFEEVQIQWRRKEAEDDALCIGMPGLFVQNNELLNSAAKFLTRSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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