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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002328`

染色体: Chr06 坐标: 33662353-33669495 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002328`
名称	SmilChr06G002328
描述	uncharacterized SmilChr06G002328
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	33662353 - 33669495 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989153`
GeneID	`130989153`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989153`
原始查询	`SmilChr06G002328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0549655; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os11g0549655; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G66550` (AT5G66550) Maf-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836787] identity=53.5; qcov=1.06; evalue=2.66e-67; confidence=high
Rice	`Os11g0549655` - identity=53.4; qcov=1.08; evalue=3.37e-69; confidence=high
GO	GO:0047429 (nucleoside triphosphate diphosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02545 (Maf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989153

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769072.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769072.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057769073.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769072.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:33665272`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B61,C47
`Chr6:33665272`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B61,C47
`Chr6:33666857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:33668103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769072.1

214 aa

107

214

Maf

PF02545 Maf 16-209 aa

XP_057769073.1

189 aa

189

Maf

PF02545 Maf 16-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769072.1`	Pfam	`PF02545`	Maf	Domain	16	209	7.5e-43	147.1	Maf-like protein
`XP_057769073.1`	Pfam	`PF02545`	Maf	Domain	16	184	2.9e-31	109.3	Maf-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913090.1
TTGTGCGGGGTAGAATTTACCCTCAAGTTCATACAAAATGAATTACTACAAACACCCCACATCGGAGACCACAAAAACAACTACGCTGGAAGACAACTACAAGAAGCATCTACAAGTTATTAATGTGGCAATAAATATGGCACTCATGATTACATATATTCCCTATGATAGCACCAACGTGGATGTTCTATGTCTTTTTTTTTTTTTAGAGGAATGGATGTTGTAATGTTGGTAAGAGCTAGAAAGGATAGTTGACTATT...

XM_057913089.1
TTACCCTCAAGTTCATACAAAATGAATTACTACAAACACCCCACATCGGAGACCACAAAAACAACTACGCTGGAAGACAACTACAAGAAGCATCTACAAGTTATTAATGTGGCAATAAATATGGCACTCATGATTACATATATTCCCTATGATAGCACCAACGTGGATGTTCTATGTCTTTTTTTTTTTTTAGAGGAATGGATGTTGTAATGTTGGTAAGAGCTAGAAAGGATAGTTGACTATTGACTAGTTTTATGTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989153
ATGGACGACAGCCACCTCAGATTCCCTCCCAAAAACCAGAATTTCGAGATAATTTTGGGTTCGTCCTCGAAGGCGCGTCGGGAGATTCTGGCTGAGATGGGCTATGAGTTCACAATCATGAGTGCAGATATAGATGAGCAAAGTATCAGGAAGGAAAGACCTGAAGACCTTGTTATGGTCCTAGCTGAAGCAAAGGCTGATGCTATTATGAAGAAGCTCAAGAGTTGTGATCAAGTGGAGGAAATGTCACGTTCTACCCT...

LOC130989153
ATGGACGACAGCCACCTCAGATTCCCTCCCAAAAACCAGAATTTCGAGATAATTTTGGGTTCGTCCTCGAAGGCGCGTCGGGAGATTCTGGCTGAGATGGGCTATGAGTTCACAATCATGGCTGATGCTATTATGAAGAAGCTCAAGAGTTGTGATCAAGTGGAGGAAATGTCACGTTCTACCCTGCTGATAACTGCTGATACAGTGGTGGTGTATCAAGGGGCTATTAGAGAAAAGCCATCGAGTGAGGAAGAAGCACG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769072.1
MDDSHLRFPPKNQNFEIILGSSSKARREILAEMGYEFTIMSADIDEQSIRKERPEDLVMVLAEAKADAIMKKLKSCDQVEEMSRSTLLITADTVVVYQGAIREKPSSEEEARKFIRDYSGGSGKVVGSVVVTNLVTGSRKGGWESAEVYFLEIPDEVIDSLIEEGITLNVAGGLMLEHPLILPLVDTVVGTADCVMGLSKTLTEKLIQEALVES

XP_057769073.1
MDDSHLRFPPKNQNFEIILGSSSKARREILAEMGYEFTIMADAIMKKLKSCDQVEEMSRSTLLITADTVVVYQGAIREKPSSEEEARKFIRDYSGGSGKVVGSVVVTNLVTGSRKGGWESAEVYFLEIPDEVIDSLIEEGITLNVAGGLMLEHPLILPLVDTVVGTADCVMGLSKTLTEKLIQEALVES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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