当前解析结果
SmilChr06G002356| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002356 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002356 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002356 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 34306879 - 34307881 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990797 |
|---|---|
| GeneID | 130990797 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990797 |
| 原始查询 | SmilChr06G002356 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=52.5; qcov=0.327; evalue=5.78e-24; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990797 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771014.1 |
| 2 | Telomere | 端粒 | 0.40000 | XP_057771014.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057771014.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771014.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771014.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:34307203 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B100,B87,D9 |
Chr6:34307209 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B100,B87,D9 |
Chr6:34307236 |
CTT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A3,B107,B11,B17,B49,B79,B87,B9,B90,B92 |
Chr6:34307304 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B37,C63 |
Chr6:34307365 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 15 | A19,A5,B100,B112,B121,B73,B80,B98,C24,C43,C46,C49,C83,D1,D2 |
Chr6:34307399 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B80,C2,C32,C68,D3 |
Chr6:34307399 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B80,C2,C32,C68,D3 |
Chr6:34307418 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr6:34307420 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C2 |
Chr6:34307420 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr6:34307450 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C42,C80 |
Chr6:34307466 |
CCT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 17 | A3,B11,B17,B5,B62,B76,B79,B9,B92,C10,C28,C30,C32,C39,C68,C7,C76 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。