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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002359`

染色体: Chr06 坐标: 34386766-34388912 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002359`
名称	SmilChr06G002359
描述	uncharacterized SmilChr06G002359
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34386766 - 34388912 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989177`
GeneID	`130989177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989177`
原始查询	`SmilChr06G002359`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	embryo defective 2423 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824006]; symbol=EMB2423; hit=AT3G48470; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	embryo defective 2423 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824006]; symbol=EMB2423; hit=AT3G48470; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G48470` (EMB2423) embryo defective 2423 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824006] identity=52.1; qcov=0.696; evalue=5.68e-26; confidence=medium
Rice	`Os02g0598800` - identity=55.6; qcov=0.587; evalue=8.69e-25; confidence=medium
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0007004 (telomere maintenance via telomerase); GO:0042162 (telomeric repeat DNA binding); GO:0050821 (protein stabilization); GO:0051879 (Hsp90 protein binding); GO:0070209 (GO:0070209)
KEGG	-
Pfam	PF25320 (TELO2_ARM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769098.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057769098.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057769098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34387484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	61	A14,A15,A6,A7,B100,B102,B103,B106,B111,B113,B119,B121,B13,B133,B134,B137,B138,B139,B15,B18,B24,B29,B31,B32,B34,B38,B39,B40,B47,B5,B50,B53,B56,B57,B6,B62,B64,B68,B86,B94,B96,C1,C12,C15,C22,C24,C25,C34,C46,C47,C49,C51,C56,C60,C63,C64,C7,C73,C76,C77,D1
`Chr6:34387494`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A11,A13,A25,A6,A8,B102,B103,B104,B12,B127,B17,B26,B3,B30,B50,B55,B61,B7,B71,B81,B86,B92,B93,B99,C1,C13,C32,C33,C34,C42,C61,C62,C82,C86,D3,D8
`Chr6:34387749`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	121	A10,A11,A14,A15,A18,A23,A4,A6,A7,A9,B100,B102,B103,B105,B106,B11,B111,B112,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B128,B13,B131,B133,B134,B137,B138,B139,B15,B16,B17,B18,B19,B23,B24,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B38,B39,B40,B41,B46,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B6,B62,B64,B66,B68,B69,B75,B78,B80,B85,B86,B87,B9,B94,B97,C1,C12,C14,C15,C17,C19,C22,C23,C24,C25,C26,C30,C31,C34,C35,C4,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C72,C73,C74,C76,C77,C84,C9,D1,D2,D6
`Chr6:34387786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B101,C2,C32,C68
`Chr6:34387799`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A18,A23,A7,B11,B124,B128,B131,B14,B3,B51,B55,B69,B97,C23,C26,C61,C64,C66,D4
`Chr6:34387801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B104
`Chr6:34387904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B104
`Chr6:34388014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B108,B12,B135,B56,B63,B83,B96,C19,C50,C59,C77
`Chr6:34388024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:34388043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B58,B66
`Chr6:34388062`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	180	A1,A10,A11,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A4,A6,A7,A9,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B11,B110,B111,B112,B113,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B128,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B36,B38,B39,B40,B41,B44,B46,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B85,B86,B87,B89,B9,B94,B96,B97,B98,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C26,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C4,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C8,C82,C84,C87,C9,D1,D11,D2,D4,D5,D6,D7
`Chr6:34388066`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A1,B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769098.1

138 aa

138

TELO2_ARM

PF25320 TELO2_ARM 25-88 aa

XP_057769099.1

138 aa

138

TELO2_ARM

PF25320 TELO2_ARM 25-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769098.1`	Pfam	`PF25320`	TELO2_ARM	Repeat	25	88	1.8e-29	103.6	TELO2 ARM repeat domain
`XP_057769099.1`	Pfam	`PF25320`	TELO2_ARM	Repeat	25	88	1.8e-29	103.6	TELO2 ARM repeat domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090524.1
AAAATGGCCGGTCATAATTCACAACACACCTTCAATCCCCTCTCTCTCTTCCTCTCCGGTTCTCCCTCTCCCTCTTGCCACCCGTCCGCCGCGCCGCGGCCACTCAATCTCCGGCAATCGCATCGGCAGCAGCGCCGTACAGCCACCACCACCGCGACGCATAGCGGCAGCAGATCTCTGGTCGCGCTGGAAGCCTTTGCTGCAGATCTCGGGCTGGACGGTGTCGAACTCGACTGCGAAGATGGCGGTGGCTAACGGAC...

XR_009090522.1
GGTCATAATTCACAACACACCTTCAATCCCCTCTCTCTCTTCCTCTCCGGTTCTCCCTCTCCCTCTTGCCACCCGTCCGCCGCGCCGCGGCCACTCAATCTCCGGCAATCGCATCGGCAGCAGCGCCGTACAGCCACCACCACCGCGACGCATAGCGGCAGCAGATCTCTGGTCGCGCTGGAAGCCTTTGCTGCAGATCTCGGGCTGGACGGTGTCGAACTCGACTGCGAAGATGGCGGTGGCTAACGGACGACGCGATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989177
ATGTGGGACGAGTTCAGCCAAGTGATTCTAGCAACTATGGGCTTTATATTCCTGGTCTCTGCCTGCAGCAGGACTAAAGAAGATCTAGATGCAATGAAAGATGCATTGCACTTAATTCTTCAGGGAATTAGTTGTAGATTGAAGAATCATGTATATTTGATTCAAAAAATGGCAAGCAGTATTGCTTTAGTATTTTCAAAGATTATAGACCCAAATAATCCTTTGTATCTTGACGATAGTTGCCAGGAAGAAACCATTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769098.1
MWDEFSQVILATMGFIFLVSACSRTKEDLDAMKDALHLILQGISCRLKNHVYLIQKMASSIALVFSKIIDPNNPLYLDDSCQEETIDWDFGLATPSPREVSATTKVLGGEKAQERESSSTLIRMVTLELDFTVIDCET

XP_057769099.1
MWDEFSQVILATMGFIFLVSACSRTKEDLDAMKDALHLILQGISCRLKNHVYLIQKMASSIALVFSKIIDPNNPLYLDDSCQEETIDWDFGLATPSPREVSATTKVLGGEKAQERESSSTLIRMVTLELDFTVIDCET

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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