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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002361`

染色体: Chr06 坐标: 34397679-34398254 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002361`
名称	SmilChr06G002361
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00860-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34397679 - 34398254 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990799`
GeneID	`130990799`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990799`
原始查询	`SmilChr06G002361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=48.2; qcov=0.717; evalue=6.61e-39; confidence=medium
Rice	`Os08g0202300` - identity=49.2; qcov=1; evalue=9.38e-60; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990799

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771016.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057771016.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771016.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771016.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771016.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34397708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C16,C2
`Chr6:34397744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C14,C83
`Chr6:34397769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B123,B125,B136,B14,B44,B74,B90,B92,C58,C87,D7
`Chr6:34397776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B68,C2
`Chr6:34397807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr6:34397812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr6:34397826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B68,C2
`Chr6:34397854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A8,B114,B25,B31,B48,B97,C16,C28,C3,C41,C59,C62,C81,C83
`Chr6:34397857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr6:34397862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:34397864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr6:34397877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B64,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771016.1

191 aa

191

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF17919 RT_RNaseH_2 103-190 aa PF17917 RT_RNaseH 129-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771016.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	103	190	3.4e-29	101.6	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057771016.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	129	190	4.7e-18	66.0	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915033.1
ATGGCGGACCATTATCTACATCTCCAATCGGTTTTCGATTGTTTGATAACTAACCAATACTGCTTGAAGCTTTCCAAGTGTGTTTTTGGCCAAATTTCAGTTGATTATTTGGGGCATATCTTGACCAACGGCTGTGTTATGGCTGACCCGAGCAAGCTCTCGGCAATGGAAACATGGCCTGTTCCCAAGACACAGAGGCAGCTTAGGGCATTCCTAGGCCTGACCGGATACTATCGCCGCTTCGTGCGGGGGTATGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990799
ATGGCGGACCATTATCTACATCTCCAATCGGTTTTCGATTGTTTGATAACTAACCAATACTGCTTGAAGCTTTCCAAGTGTGTTTTTGGCCAAATTTCAGTTGATTATTTGGGGCATATCTTGACCAACGGCTGTGTTATGGCTGACCCGAGCAAGCTCTCGGCAATGGAAACATGGCCTGTTCCCAAGACACAGAGGCAGCTTAGGGCATTCCTAGGCCTGACCGGATACTATCGCCGCTTCGTGCGGGGGTATGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771016.1
MADHYLHLQSVFDCLITNQYCLKLSKCVFGQISVDYLGHILTNGCVMADPSKLSAMETWPVPKTQRQLRAFLGLTGYYRRFVRGYAGIAAPLTDLLRKDSFQWTPAAQEAFDALKAAMTSVPVLHLPHFEHEFIVETDASNVGMGAVLMQLEHPIAFFSKKLGPRLQAASTYMKELYAITESVRKWRQYLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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