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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002379`

染色体: Chr06 坐标: 34632143-34635268 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002379`
名称	SmilChr06G002379
描述	uncharacterized SmilChr06G002379
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34632143 - 34635268 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989201`
GeneID	`130989201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989201`
原始查询	`SmilChr06G002379`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calcium dependent protein kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830366]; symbol=CPK1; hit=AT5G04870; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	calcium dependent protein kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830366]; symbol=CPK1; hit=AT5G04870; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G04870` (CPK1) calcium dependent protein kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830366] identity=24.2; qcov=0.781; evalue=3.37e-09; confidence=weak
Rice	`Os03g0808600` (OsCDPK8) - identity=26.9; qcov=0.769; evalue=7.58e-09; confidence=low
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769130.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769130.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057769131.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057769131.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057769131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34634446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:34634802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B139,B32,B97,C4
`Chr6:34634887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B114,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769130.1

187 aa

187

EF-hand_7

EF-hand_8

PF13499 EF-hand_7 7-65 aa PF13833 EF-hand_8 19-66 aa

XP_057769131.1

169 aa

169

EF-hand_7

EF-hand_8

PF13499 EF-hand_7 7-65 aa PF13833 EF-hand_8 19-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769130.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	7	65	2e-19	70.4	EF-hand domain pair
`XP_057769130.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	19	66	5.7e-11	42.7	EF-hand domain pair
`XP_057769131.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	7	65	1.2e-19	71.1	EF-hand domain pair
`XP_057769131.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	19	66	4e-11	43.2	EF-hand domain pair

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913147.1
TTTCAAGGATATACTTTGATTTTTGCACAAGAAAAGATAAATTATTAATTCTTTATCCAAATTTACAAATACCATTGGTTGAAAATGTTGTCAAATTGGAAAAGGAACAAACTTCAAAACAAGGGAAAGAATCTTTACATCATTTGTGCTTGTTAATGAGTTTATTGAAATCACTCGAAATTCAATTCTCGTATCTTCATTTTTTATTTTATTAGAATAATATAACAAAAGTAAAAGAAAATCAATTTCCAGTGCTTAAA...

XM_057913148.1
TTTCAAGGATATACTTTGATTTTTGCACAAGAAAAGATAAATTATTAATTCTTTATCCAAATTTACAAATACCATTGGTTGAAAATGTTGTCAAATTGGAAAAGGAACAAACTTCAAAACAAGGGAAAGAATCTTTACATCATTTGTGCTTGTTAATGAGTTTATTGAAATCACTCGAAATTCAATTCTCGTATCTTCATTTTTTATTTTATTAGAATAATATAACAAAAGTAAAAGAAAATCAATTTCCAGTGCTTAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989201
ATGGAGAATCGGGAAATTCTGCGAGAGTGGTTTGATCGTGTTGACTCGCAGAAAACCGGAAATATAACTGCTGCTCAGCTCAAGAGTGCTTTGGCAGTCGGAAACCTTCAATTCCCTCTATCAGTTGTTCAGCAAATGATCAGGATGTATGATTTCGACAGTAATGGAACTATGAGCTTTGAAGAATTTTTTGAACTTAACAAGTTCCTTCTGAAGGTGCAACAGGCATATTCAAGCTTGGAGAGGGGGCGTGGATTTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769130.1
MENREILREWFDRVDSQKTGNITAAQLKSALAVGNLQFPLSVVQQMIRMYDFDSNGTMSFEEFFELNKFLLKVQQAYSSLERGRGFLVPDEAYEALVKIGFSLDSPAFYTVCESFDQTKSGKLRLDDFISICIFVQSTRNLFNSFDTSKQGRVTLDFNQFVYCSKYCNSVLHLNFRFPARSLELARR

XP_057769131.1
MENREILREWFDRVDSQKTGNITAAQLKSALAVGNLQFPLSVVQQMIRMYDFDSNGTMSFEEFFELNKFLLKVQQAYSSLERGRGFLVPDEAYEALVKIGFSLDSPAFYTVCESFDQTKSGKLRLDDFISICIFVQSTRNLFNSFDTSKQGRVTLDFNQFVYCTSNCRI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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