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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002386`

染色体: Chr06 坐标: 34665457-34667501 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002386`
名称	SmilChr06G002386
描述	lysM domain-containing GPI-anchored protein 2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34665457 - 34667501 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989205`
GeneID	`130989205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989205`
原始查询	`SmilChr06G002386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysM domain-containing GPI-anchored protein 2
产物	lysM domain-containing GPI-anchored protein 2
Arabidopsis	`AT2G17120` (LYM2) lysm domain GPI-anchored protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816217] identity=40.2; qcov=0.991; evalue=4.25e-74; confidence=medium
Rice	`Os09g0548200` (LYP3) - identity=38.5; qcov=1.05; evalue=4.08e-72; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01476 (LysM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769140.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769140.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769140.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769140.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34665892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr6:34665910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:34665949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:34667133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:34667144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:34667198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B139,B32,C4
`Chr6:34667220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B44,B61,C80
`Chr6:34667229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C62
`Chr6:34667250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769140.1

351 aa

176

351

LysM

PF01476 LysM 112-158 aa PF01476 LysM 176-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769140.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	112	158	3.3e-20	72.5	LysM domain
`XP_057769140.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	176	219	3.3e-20	72.5	LysM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913157.1
ATGGCCTCTCCCACCAAGCTAACAGTAACACCACTCCTCTTCATCATCACCCTCATCTCCATCTCCATCTCCCCCGCCTCCGCGAAAACCTTCCGCTGCACCTCCGGCGGCGCCACCTGCGACGCCGTGGTCGACTACGTGTCCCCCAACCGCACCACCCTCGGCGCCATCCAGTCCCTCTTCACGGTGCCGCACCTCCGCTCCATCCTCGGCGCCAACAACTTCACCCTCAACTCCACCGGAAGAACCCCCGTCGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989205
ATGGCCTCTCCCACCAAGCTAACAGTAACACCACTCCTCTTCATCATCACCCTCATCTCCATCTCCATCTCCCCCGCCTCCGCGAAAACCTTCCGCTGCACCTCCGGCGGCGCCACCTGCGACGCCGTGGTCGACTACGTGTCCCCCAACCGCACCACCCTCGGCGCCATCCAGTCCCTCTTCACGGTGCCGCACCTCCGCTCCATCCTCGGCGCCAACAACTTCACCCTCAACTCCACCGGAAGAACCCCCGTCGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769140.1
MASPTKLTVTPLLFIITLISISISPASAKTFRCTSGGATCDAVVDYVSPNRTTLGAIQSLFTVPHLRSILGANNFTLNSTGRTPVEAKQTVRIPFPCICRNGTGVSNGRPVYTVVSGDGLYHIAADVFSNIVTVAEIVAANNIENPDVILVGQNLTIPMPCSCDAVDGAAVVHYGHEVAAGSSIEGIAQQYNVSQETLMQLNNLTGPQDLKAEDIIDVPLRACSSMVTNSSLDYPLLVPSNAYVVTANTCVKCKCNTAMN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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