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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002389`

染色体: Chr06 坐标: 34690614-34693094 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002389`
名称	SmilChr06G002389
描述	protein HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE PHENOTYPE 244, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34690614 - 34693094 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989209`
GeneID	`130989209`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989209`
原始查询	`SmilChr06G002389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE PHENOTYPE 244, chloroplastic
产物	protein HIGH CHLOROPHYLL FLUORESCENCE PHENOTYPE 244%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G35250` (HCF244) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829678] identity=87.6; qcov=0.892; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0553800` (OJ1125_C01.13-1) - identity=86.9; qcov=0.882; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF05368 (NmrA); PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989209

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769147.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057769147.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057769147.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769147.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34691187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:34691356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,C17,C27,C63,D3
`Chr6:34691362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,D11
`Chr6:34691876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B139,B32,C4
`Chr6:34692925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B52,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769147.1

390 aa

195

390

NmrA

Epimerase

3Beta_HSD

NAD_binding_10

PF05368 NmrA 76-320 aa PF01370 Epimerase 77-182 aa PF01073 3Beta_HSD 78-183 aa PF13460 NAD_binding_10 81-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769147.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	76	320	2.8e-27	96.8	NmrA-like family
`XP_057769147.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	77	182	3e-11	43.9	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057769147.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	78	183	3.5e-05	23.7	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057769147.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	81	230	9.6e-18	65.4	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913164.1
TTTTCTCATAATAAATTCACAACCAAATAAAATGCAGCCTAAAATAAAAATGTTTTCATCGAATTAATATAGTTTAAATTTCCGGTAAATTGACTCACGTGACGAAGCACGTGTACCAACGGTAAGCGCACGTTAGCAAGTGGCAGCTGAGGTGGACTCGAGCTCAACCGTAATCCAAACTTGCCGACGTGGCATCTTTCACATCTGTTGTTCTTCTTCCTTCCCCTTTCTCTCTCTCATCTCTCCTTTTCTCTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989209
ATGGCCTCAACTCTCCAAGCTCAGCTATCCGCCCCTCTCAAGCACAACCTCCGCTCACACGCCTCACTTTCATGGCGCCGCAATTTATCATCCGACGCCATTGCCTCCACCTCCTCTTCTACTCTCATCACTAAAGGTAGGGGCAACGCGGCGGTGATAACTTGCAACGCCCAGGCTGCGCCAGCGGCGGTCAATTTGGCACCCGGAACGCCGGTCCGGCCCACGAGCATACTGGTGGTGGGCGCCACGGGCACATTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769147.1
MASTLQAQLSAPLKHNLRSHASLSWRRNLSSDAIASTSSSTLITKGRGNAAVITCNAQAAPAAVNLAPGTPVRPTSILVVGATGTLGRQIVRRALDEGYDVRCLVRPRPAPADFLRDWGATVVNADLSKPESIPATLVGVHTVIDCATGRPEEPINTVDWEGKVALIQCAKAMGIQKFVFFSIHNCDKHPEVPLMEIKYCTEKFLRDSGLNHIVIRLCGFMQGLIGQYAVPILEEKSVWGTDAPTRIAYMDTQDIARLTF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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