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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002396`

染色体: Chr06 坐标: 34738967-34740218 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002396`
名称	SmilChr06G002396
描述	uncharacterized SmilChr06G002396
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34738967 - 34740218 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990808`
GeneID	`130990808`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990808`
原始查询	`SmilChr06G002396`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carrier protein (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829674]; symbol=AT4G35210; hit=AT4G35210; species=arabidopsis; confidence=low
产物	carrier protein (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829674]; symbol=AT4G35210; hit=AT4G35210; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G35210` (AT4G35210) carrier protein (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829674] identity=35.6; qcov=1.05; evalue=1.89e-10; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990808

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771026.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771026.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771026.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771026.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34738972`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B65,C18,C49
`Chr6:34738972`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B65,C18,C49
`Chr6:34738984`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A16,A25,A4,A7,B106,B109,B11,B112,B115,B126,B132,B135,B138,B14,B19,B20,B45,B56,B70,B71,B73,B79,B83,B89,B93,B96,B99,C1,C11,C19,C26,C3,C34,C41,C44,C51,C59,C69,C74,C77
`Chr6:34738986`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	55	A11,A19,A24,A3,A8,B102,B105,B107,B114,B13,B134,B16,B23,B31,B33,B35,B37,B41,B44,B46,B53,B58,B61,B66,B76,B77,B78,B84,B90,B91,B92,B94,C17,C18,C21,C27,C29,C32,C33,C37,C42,C48,C5,C53,C58,C61,C63,C64,C66,C68,C79,C80,C83,D10,D3
`Chr6:34739144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B55
`Chr6:34739156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:34739928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B137,C2
`Chr6:34739928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C2
`Chr6:34739929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:34739944`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C67
`Chr6:34739944`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C67
`Chr6:34739955`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B29,B4,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771026.1

165 aa

165

BPS1

PF03087 BPS1 91-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771026.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	91	158	3.2e-15	57.3	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915043.1
ATGGCTCTTCACCACAGCCGCTCTCTTAGCTTCCCATCTGCATCACATCCTGCTGTTTCCCACTTCGATGAAAACTTATCAAGATTGAGATCTTCGGAGGCTGCTTGCTCCTCCCTCTCATCAATCAACGCCACAATCAGAAGCTCCAACTGTGACAGCCCATGTTTAAGGGATTTCGACTTCAGCGGTGAATCTATTGAGATCTTCCGAGACTGCTTGCTCGTCGCTCTCATCCATCAACCGCGCTGCAAATGGCCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990808
ATGGCTCTTCACCACAGCCGCTCTCTTAGCTTCCCATCTGCATCACATCCTGCTGTTTCCCACTTCGATGAAAACTTATCAAGATTGAGATCTTCGGAGGCTGCTTGCTCCTCCCTCTCATCAATCAACGCCACAATCAGAAGCTCCAACTGTGACAGCCCATGTTTAAGGGATTTCGACTTCAGCGGTGAATCTATTGAGATCTTCCGAGACTGCTTGCTCGTCGCTCTCATCCATCAACCGCGCTGCAAATGGCCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771026.1
MALHHSRSLSFPSASHPAVSHFDENLSRLRSSEAACSSLSSINATIRSSNCDSPCLRDFDFSGESIEIFRDCLLVALIHQPRCKWPQIEIVSEECVDDYISLLDASSSVKDLISLVKEDLRELLSAVRRKDVRGINGYLALRKQSKKKIQKCLKMLENGGDYIEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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