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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002401`

染色体: Chr06 坐标: 34775449-34776204 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002401`
名称	SmilChr06G002401
描述	uncharacterized SmilChr06G002401
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34775449 - 34776204 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990812`
GeneID	`130990812`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990812`
原始查询	`SmilChr06G002401`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT2G17080; symbol=AT2G17080; hit=AT2G17080; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT2G17080; symbol=AT2G17080; hit=AT2G17080; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G17080` (AT2G17080) - identity=38.2; qcov=1.04; evalue=2.5e-36; confidence=medium
Rice	`Os11g0160000` - identity=32.2; qcov=1.05; evalue=7.01e-20; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990812

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771031.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771031.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057771031.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771031.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771031.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34775565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:34775566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A13,A16
`Chr6:34775646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B131,C59
`Chr6:34775692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:34775704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B98
`Chr6:34775730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr6:34775743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr6:34775754`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A21,C14,C2,C32,C68
`Chr6:34775754`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A21,C14,C2,C32,C68
`Chr6:34775795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr6:34775861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B47,B57,B90,B92
`Chr6:34775862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C18,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771031.1

251 aa

126

251

BPS1

PF03087 BPS1 47-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771031.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	47	248	2.3e-49	169.1	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915048.1
ATGGCTCTTCACCACAGCCGCTCTCTTAGTTTGCCATCTGCATCACATCCTGCCCTTTCTCACTTTGATGACAACTTATCCAGATTGAGATCTTCGGAAGCTGCTTGCTCCACACTCTCATCCTTCAATGCCACAATTAACGGCCTCAGAAATTTATATGAGAGCATTGATGATTTGCTTCTTTTGTCTTCCATTCAACAGATCATTTCTGAGGAGTGTGTTGATGATTACATCAAACTATTGGATGCTTCCAGTTCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990812
ATGGCTCTTCACCACAGCCGCTCTCTTAGTTTGCCATCTGCATCACATCCTGCCCTTTCTCACTTTGATGACAACTTATCCAGATTGAGATCTTCGGAAGCTGCTTGCTCCACACTCTCATCCTTCAATGCCACAATTAACGGCCTCAGAAATTTATATGAGAGCATTGATGATTTGCTTCTTTTGTCTTCCATTCAACAGATCATTTCTGAGGAGTGTGTTGATGATTACATCAAACTATTGGATGCTTCCAGTTCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771031.1
MALHHSRSLSLPSASHPALSHFDDNLSRLRSSEAACSTLSSFNATINGLRNLYESIDDLLLLSSIQQIISEECVDDYIKLLDASSSVKDLISLAKQDLRELLSAVRRKDAQGINGYHASRNRSKKMIKTCLKKLKRSRASATSENVSLLKDAESVAISLLESLLSYTLGRKMQETKSSWSLVSKLMHSKKASDDENEFNEVDSLLQLNQENELVNQIKKMDSSIQVLEEGLELVFRQLIKTRVSLLNILNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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