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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002405`

染色体: Chr06 坐标: 34813585-34814647 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002405`
名称	SmilChr06G002405
描述	uncharacterized SmilChr06G002405
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34813585 - 34814647 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990814`
GeneID	`130990814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990814`
原始查询	`SmilChr06G002405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0225900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=23.7; qcov=0.603; evalue=3.58e-06; confidence=weak
Rice	`Os08g0225900` - identity=26.4; qcov=1.19; evalue=8.17e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771033.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771033.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771033.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771033.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771033.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34813585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr6:34813601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	150	A1,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B1,B101,B104,B105,B108,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B138,B17,B18,B19,B21,B22,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B36,B4,B42,B43,B45,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B58,B59,B6,B60,B62,B64,B65,B67,B68,B69,B72,B75,B79,B8,B80,B81,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B95,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C19,C20,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C45,C5,C50,C53,C54,C56,C57,C6,C60,C65,C67,C69,C70,C71,C72,C73,C76,C77,C78,C79,C83,C84,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D8,D9
`Chr6:34813631`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	39	A13,A24,A3,A5,A6,B101,B103,B104,B114,B127,B132,B137,B15,B17,B19,B30,B40,B41,B44,B45,B50,B67,B71,B76,B94,B96,B98,C10,C12,C22,C25,C29,C4,C56,C63,C67,C77,D11,D5
`Chr6:34813638`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A13,A24,A3,A5,A6,B101,B103,B104,B114,B127,B132,B137,B15,B17,B19,B40,B41,B44,B45,B50,B67,B71,B76,B96,B98,C12,C22,C25,C29,C36,C4,C56,C63,C67,C77,D11,D5
`Chr6:34813642`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B32
`Chr6:34813642`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B32
`Chr6:34813644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A16,A19,A23,B10,B100,B101,B110,B113,B114,B120,B128,B13,B131,B139,B140,B16,B29,B32,B33,B66,B86,C14,C35,C4,C45,C5,C52,C59,C64,C66,C81,C9,D6,D8
`Chr6:34813682`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A19,B10,B100,B101,B110,B113,B114,B128,B13,B140,B16,B29,B33,B52,B86,C14,C35,C45,C49,C5,C52,C66,C81,C9,D10,D4,D6,D8
`Chr6:34813700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B23,C49,D10
`Chr6:34813706`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B65,C18,C49
`Chr6:34813706`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B65,C18,C49
`Chr6:34813709`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	B103,B135,B2,B27,B33,B38,B44,B51,B52,B57,B78,C31,C36,C46,C55,C57,C6,C61,C64,C66,C73,C8,C82,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771033.1

315 aa

158

315

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 175-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771033.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	175	307	1.3e-11	46.3	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915050.1
ATGCCTAATCCTCAAATATATCCTAACAATCCCATGAGTCAATCGGTCCCTCCATTTCAATTTTCATCCCAAGGGCATCCACCTCAGGGGTTTCAGCTATACGGCTATCCCCCGAGTTGGTATCCCCCGCCAGGGTTTCCCCCGCAAGGATATCCTTCACAGGGGTTTATGTTTATAGACTCATCTAGGAGAAGCAGCATAGATGGGAGTGGTACTAATGGAGGGAGACCATCCTCAAGAAAGGCAGTTCAAGATTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990814
ATGCCTAATCCTCAAATATATCCTAACAATCCCATGAGTCAATCGGTCCCTCCATTTCAATTTTCATCCCAAGGGCATCCACCTCAGGGGTTTCAGCTATACGGCTATCCCCCGAGTTGGTATCCCCCGCCAGGGTTTCCCCCGCAAGGATATCCTTCACAGGGGTTTATGTTTATAGACTCATCTAGGAGAAGCAGCATAGATGGGAGTGGTACTAATGGAGGGAGACCATCCTCAAGAAAGGCAGTTCAAGATTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771033.1
MPNPQIYPNNPMSQSVPPFQFSSQGHPPQGFQLYGYPPSWYPPPGFPPQGYPSQGFMFIDSSRRSSIDGSGTNGGRPSSRKAVQDLENINISVEPQSDDDEHNTNKPRAFYSDAESEVLAQCWIDISIDSVVGNDQKMEQMWKRITEAYNKSGANDADIMEMAQPEYKQHHGTQGFKYIGVWRILSTVPKFVEVQGNVQASKRTKNREGGAYTSSSTAEDTTTSRPMGQKAAKRKAKGKGKKEDLSALKELVSKHEDNAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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