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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002411`

染色体: Chr06 坐标: 34847788-34848543 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002411`
名称	SmilChr06G002411
描述	uncharacterized SmilChr06G002411
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34847788 - 34848543 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990816`
GeneID	`130990816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990816`
原始查询	`SmilChr06G002411`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT2G17080; symbol=AT2G17080; hit=AT2G17080; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT2G17080; symbol=AT2G17080; hit=AT2G17080; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G17080` (AT2G17080) - identity=42.8; qcov=1.05; evalue=2.37e-47; confidence=medium
Rice	`Os11g0160000` - identity=32.1; qcov=1.06; evalue=5.39e-22; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771035.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771035.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771035.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771035.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34847845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B18,B25,C84
`Chr6:34847851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C43
`Chr6:34847887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,C32,C40,C68
`Chr6:34847889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A21,A8,B1,B103,B11,B12,B25,B61,B93,C1,C10,C13,C19,C30,C37,C56,C59,C79,C84,D2
`Chr6:34847923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:34847928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A10,C86
`Chr6:34847928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C86
`Chr6:34847965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,A16
`Chr6:34847996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr6:34848010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:34848041`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B38,B52,C31,C4,C55,C64,C8
`Chr6:34848046`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B38,B52,C31,C4,C55,C64,C8,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771035.1

251 aa

126

251

BPS1

PF03087 BPS1 47-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771035.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	47	248	1e-54	186.6	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915052.1
ATGGCTCTTCACCACAGCCGCTCTCTTAGCTTCCCATCTTCATCACATCCTGCTCTTACTCACTTCGATGACAGCTTATCCAGAGTGAGATCTTCGGAAGCTGCTTGCTGCTCGCTCTCATCAATCAACGCCACAATAAATGGCCTCAAAAACCTGTACGATAGCATTGATGATTTGCTGCTCTTGCCTCACATTCAACAGGTCGTATCTGAGGAATGTGTCGATGATTGCATTAGGCTATTGGATGCGTGCAGCTCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990816
ATGGCTCTTCACCACAGCCGCTCTCTTAGCTTCCCATCTTCATCACATCCTGCTCTTACTCACTTCGATGACAGCTTATCCAGAGTGAGATCTTCGGAAGCTGCTTGCTGCTCGCTCTCATCAATCAACGCCACAATAAATGGCCTCAAAAACCTGTACGATAGCATTGATGATTTGCTGCTCTTGCCTCACATTCAACAGGTCGTATCTGAGGAATGTGTCGATGATTGCATTAGGCTATTGGATGCGTGCAGCTCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771035.1
MALHHSRSLSFPSSSHPALTHFDDSLSRVRSSEAACCSLSSINATINGLKNLYDSIDDLLLLPHIQQVVSEECVDDCIRLLDACSSVKDLISLSKQNLRELLSAIRRKDVRGINTYLASRKRLKKMIQKCLKKLRRSSASATSENASLLKDAESVAISLLESLLSYMLGTKMQERKSSWSLVSKLMQSKKASDEENEFNKVDSLLQLNQENELVNHLKQMESSIQDVEEKLESTFRQLIKTRVSLLNILNH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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