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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002419`

染色体: Chr06 坐标: 34930287-34932685 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002419`
名称	SmilChr06G002419
描述	expansin-like A2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34930287 - 34932685 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989224`
GeneID	`130989224`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989224`
原始查询	`SmilChr06G002419`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-like A2
产物	expansin-like A2
Arabidopsis	`AT3G45970` (EXLA1) expansin-like A1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823740] identity=61.9; qcov=1.01; evalue=3.87e-108; confidence=high
Rice	`Os03g0132200` (OsEXPLA1) - identity=52.2; qcov=0.939; evalue=1.36e-97; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989224

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057769158.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057769158.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057769158.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769158.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34931266`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B125,B38,B39,B48,B7,B84,B97,C28,C39,C72,C76
`Chr6:34932438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769158.1

263 aa

132

263

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 59-135 aa PF01357 Expansin_C 148-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769158.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	59	135	2.3e-15	57.3	Lytic transglycolase
`XP_057769158.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	148	228	4.6e-18	65.8	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913175.1
TATATTTTACCTTTTTTTGAAATGTCTGACACCTGTATTCCACCCTCACCACTACCCTTCTTTCTCTCTCTCTACATATAGATATATATATATATATATATATACGCATTTTGATCACACAATTCCATTCCCAACGAGTAAAAAACAACACACTCACTCACACAGTAGTAAAAAGCATGGCCGTATTTGGTCTTCTTCCCTTAGTAACTCTACTTCTCGCTTCATCTGCAACTGCGTGCGATCGCTGCGTCCGCCAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989224
ATGGCCGTATTTGGTCTTCTTCCCTTAGTAACTCTACTTCTCGCTTCATCTGCAACTGCGTGCGATCGCTGCGTCCGCCAATCAAAAGTCGCCTTCTTCTCCAAAGCTCAAGCTCTTCAATCTGGAGCTTGCGGCTATGGCTCTCTCGCAATCGGATTCAACGACGGCCGCATCGCAGCCGCAGCTCCGTCCATCTACAAAGACGGAGCTGCCTGCGGCGCTTGTTTTCAAATACGATGCAATAATGAGAAAATTTGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769158.1
MAVFGLLPLVTLLLASSATACDRCVRQSKVAFFSKAQALQSGACGYGSLAIGFNDGRIAAAAPSIYKDGAACGACFQIRCNNEKICSKEGTTVTVTDRSPDNATDFVLSSRAFTAMAKQGMGQELLKLGIANVEYRRVPCDYKNKNLAVRVEESSQKPHYLAIKLLYQGGQTEIVAIDIAKVGSANWNFMSRNYGAVWDTSRVPEGSLQLRFVVTAGYDGKWYWAKSVLSSDWTKGAIYDSGIQIADIAQEPCAICDDGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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