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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002428`

染色体: Chr06 坐标: 35054760-35057600 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002428`
名称	SmilChr06G002428
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35054760 - 35057600 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989234`
GeneID	`130989234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989234`
原始查询	`SmilChr06G002428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 1
产物	rop guanine nucleotide exchange factor 1
Arabidopsis	`AT4G38430` (ROPGEF1) rho guanyl-nucleotide exchange factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830000] identity=66.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0544800` (Os) - identity=64.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF03759 (PRONE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769170.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769170.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057769170.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769170.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769170.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35055034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:35055041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr6:35055189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B121,B3,C40,C87
`Chr6:35055235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B33,B53,B71,C48
`Chr6:35055246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C18,C49
`Chr6:35055662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35055794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:35055928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35056215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:35056456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:35056733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:35056775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B131,C59,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769170.1

566 aa

283

566

PRONE

PF03759 PRONE 87-458 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769170.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	87	458	2.1e-177	590.1	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913187.1
TAGGTACACCTATACATATACTCATATAGAGAGAGAAAGGAGTAGTACCTGCTGCTTTGCTTTTATAGTTGTCGGCTTTTGCTTTTTCCACTCTCCATCTTCTCCACCTTCACCACCACTCTTTTCTGCAACGAATTCTCAGGTAACGGCAGCGCTACGCTTTGCTCCTGCAAGTGAAATGGCGGCAATGTGCATCTGAGATCTCTGCATTTTCCTTCTAAAGCAAAAGGTTCATTTCGTCCGAAGCTTCGATACGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989234
ATGGGGAGTGTGTCATCGGAGGAAGGCAGCGAGGACAGGTGCGGGAGCTACAGCTTGAGCGCGGACGTCAGCGAGTCGGAGAGCTCGAATGGTGAAGTAGAGGAGGATGAGTGCGGCGGCGCTTCGAGTTCCGCGGGGTTTTCCCCCTTCGCCGCCGGCGGTTCGGCGTCCTTGTCGCCGATTTTCAGTTTTCCGGTCGTCGGAGGCAAGGATGTGGTGGTTTGGGACGAGAAGCCGCTCAAACGTAGCTCTGATTTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769170.1
MGSVSSEEGSEDRCGSYSLSADVSESESSNGEVEEDECGGASSSAGFSPFAAGGSASLSPIFSFPVVGGKDVVVWDEKPLKRSSDLSEIEMMKERFAKLLLGEDMSGGGKGVCTALAISNAITNLSATVFGELWRLEPMAPQKKAMWCREMEWLLSVSDSIVELVPSIQQYPGGGTYEVMATRPRSDLYMNLPALKKLDAMLISILDGFCDTEFWYVDRGIVVDDQDKYSPGALSGRPSVRQEEKWWLPCPKVPGKGLSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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