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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002429`

染色体: Chr06 坐标: 35057464-35059913 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002429`
名称	SmilChr06G002429
描述	F-box protein SKIP23-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35057464 - 35059913 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989235`
GeneID	`130989235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989235`
原始查询	`SmilChr06G002429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP23-like
产物	F-box protein SKIP23-like
Arabidopsis	`AT2G17030` (AT2G17030) F-box SKIP23-like protein (DUF295) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816206] identity=45.7; qcov=1.01; evalue=2.4e-108; confidence=high
Rice	`Os11g0582700` (OsFbox614) - identity=25.2; qcov=0.983; evalue=3.1e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769171.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769171.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769171.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769171.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769171.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35058702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35058727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B27,B59,C13
`Chr6:35058783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35058796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B27,B57,B59,C13
`Chr6:35058818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr6:35059063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35059149`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr6:35059149`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr6:35059161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr6:35059476`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B62
`Chr6:35059476`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B62
`Chr6:35059605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769171.1

403 aa

202

403

Beta-prop_KIB1-4

PF03478 Beta-prop_KIB1-4 66-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769171.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	66	361	2e-46	159.2	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090541.1
ACGTGCACAAGCTTCAACACGTAGTTTCTCGGAAATTCCAACTCTCCTTCGCCAACACACACTGCAGCAAATTCAAAATCCAAAATAATATTCTTCAATTTTTCCTCGCTTCAATCTTCAATGGCGGATTGGTCTACCCTCCCGGCCGAACTCCTCCACCTCATTTCCCAGCACCTACCCACCTCAACCGACGTCCTCCGCTTCCGCTCCATCTGCGCCATCTGGCGCGCCGCCGTCCCTCCTCCGCCCTCCTCCGTCGC...

XM_057913188.1
GGGAAGTAGAGTTTATTTTTAGAACGTGCACAAGCTTCAACACGTAGTTTCTCGGAAATTCCAACTCTCCTTCGCCAACACACACTGCAGCAAATTCAAAATCCAAAATAATATTCTTCAATTTTTCCTCGCTTCAATCTTCAATGGCGGATTGGTCTACCCTCCCGGCCGAACTCCTCCACCTCATTTCCCAGCACCTACCCACCTCAACCGACGTCCTCCGCTTCCGCTCCATCTGCGCCATCTGGCGCGCCGCCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989235
ATGGCGGATTGGTCTACCCTCCCGGCCGAACTCCTCCACCTCATTTCCCAGCACCTACCCACCTCAACCGACGTCCTCCGCTTCCGCTCCATCTGCGCCATCTGGCGCGCCGCCGTCCCTCCTCCGCCCTCCTCCGTCGCGCGCTTCCCCGTCCTCCCCAATTGCGGGATCTCCGACACCAGCTGGGGCTTCTACCTCTCCAAACGTACAATCTATTCCCTCCAATCGCCGCTCCCCGATCAATCCTCATGGATCATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769171.1
MADWSTLPAELLHLISQHLPTSTDVLRFRSICAIWRAAVPPPPSSVARFPVLPNCGISDTSWGFYLSKRTIYSLQSPLPDQSSWIIKLDRDNPARMRLLNPLDRSQFKSFPSAFPKLFSFFNIRVRELGEEYALQYINFRPTASSIGEAGNLYMEKVAVLNNGSSGGFVLLTIHVSGKLVVYKSGDERWRLIDDLPSPYDDVILWKGKFYAVDNTGRIVVVNTVDLNVSVAANSIFGGDKKLLVDSDGDLLVVDMYLSVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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