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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002430`

染色体: Chr06 坐标: 35068295-35070331 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002430`
名称	SmilChr06G002430
描述	uncharacterized SmilChr06G002430
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35068295 - 35070331 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989236`
GeneID	`130989236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989236`
原始查询	`SmilChr06G002430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0142200; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0142200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G34412` (AT4G34412) EKC/KEOPS complex subunit tprkb-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829592] identity=71.3; qcov=0.959; evalue=3.34e-80; confidence=high
Rice	`Os01g0142200` - identity=70.9; qcov=1.01; evalue=2.5e-84; confidence=high
GO	GO:0000408 (EKC/KEOPS complex); GO:0000722 (telomere maintenance via recombination); GO:0002949 (tRNA threonylcarbamoyladenosine modification); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF08617 (CGI-121)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769172.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057769172.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057769172.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769172.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35068553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A9,B61,B80
`Chr6:35068554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C39
`Chr6:35068567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr6:35068603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B110,B113,B86,C5
`Chr6:35068780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:35068788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C18,C49
`Chr6:35068790`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B26,C40
`Chr6:35068790`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B26,C40
`Chr6:35069221`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B11,B139,B31,C27,C56,D1
`Chr6:35069357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35070129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C35
`Chr6:35070156`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A5,A6,A8,B1,B101,B105,B109,B115,B123,B128,B129,B15,B3,B31,B32,B33,B39,B46,B47,B53,B59,B62,B79,B81,B87,B88,B9,B91,B98,B99,C12,C15,C19,C25,C26,C46,C49,C53,C55,C58,C65,C74,C8,C84,C85,D11,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769172.1

171 aa

171

CGI-121

PF08617 CGI-121 16-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769172.1`	Pfam	`PF08617`	CGI-121	Domain	16	169	7.1e-42	143.8	Kinase binding protein CGI-121

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913189.1
CATTAAGATATTTTTCTGTTTTTTTTTTCTATTCTCTCTTCCCCTCACTCTCACCGCGCCGCCTCCTTCTTCCTCGGCGCCTCCGTAAAACCCCAAATCCGCATATATTCTTCTCCACAATTTTTTGAAACGCAGAAATGAACAACTTCGAGATCGGTGGTACCACTCTCTCTCTTGCTCTCTTCGTCGACGTCACCAATTCCAAAGAGCTTTTGGAGTTGATGCAAGCAGGGACTTTGGAACCAGAAGTAGCATTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989236
ATGAACAACTTCGAGATCGGTGGTACCACTCTCTCTCTTGCTCTCTTCGTCGACGTCACCAATTCCAAAGAGCTTTTGGAGTTGATGCAAGCAGGGACTTTGGAACCAGAAGTAGCATTTCTCAATGCTTCACTTATACCAGATGTTTTCCCTGTTCTTGCTGCTGCATACAAGACGCTCGTAGCGAAATCACGAGACTCACTGATGACTCGCACTCTTCATTCGGAGCTTGTCTACAACTACTCGGGCTCCAAACATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769172.1
MNNFEIGGTTLSLALFVDVTNSKELLELMQAGTLEPEVAFLNASLIPDVFPVLAAAYKTLVAKSRDSLMTRTLHSELVYNYSGSKHISESLKRCGISDSTSYILAARFGASPDEMTALKGLIKGTYIGLEELETRADQARIHKHYKISAPELGISSVADAITCRISARDAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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