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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002447`

染色体: Chr06 坐标: 35212305-35214171 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002447`
名称	SmilChr06G002447
描述	uncharacterized SmilChr06G002447
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35212305 - 35214171 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989251`
GeneID	`130989251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989251`
原始查询	`SmilChr06G002447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox676; symbol=OsFbox676; hit=Os12g0609900; species=rice; confidence=weak
产物	OsFbox676; symbol=OsFbox676; hit=Os12g0609900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G57900` (SKIP1) SKP1 interacting partner 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835901] identity=28.8; qcov=0.533; evalue=3.44e-06; confidence=low
Rice	`Os12g0609900` (OsFbox676) - identity=23; qcov=0.872; evalue=1.12e-08; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769194.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769194.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769194.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769194.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769194.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35212663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35213809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B32
`Chr6:35213972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr6:35214035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769194.1

274 aa

137

274

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 5-47 aa PF12937 F-box-like 5-47 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769194.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	5	47	3.3e-05	24.4	F-box domain
`XP_057769194.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	5	47	5.2e-06	26.8	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913211.1
CGCAAATTCGAGTTTAGGAAAATATTCGGGGAATCGATCTAATAAAAAATAATCCAAGCTCGACAAAATTAACTCTAAAATCGAGTAGATTGTGGCTCGATTAACATCAAGTGCAAAATCTATATTTATAAAATGAAGAATTAATTTTCTACACGAAAACATTGACTCAACCTAATTTTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGATATGCATCAGCAATGGGAGGCTTTACCGAGCTTGGCTCTTGCACACATCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989251
ATGCATCAGCAATGGGAGGCTTTACCGAGCTTGGCTCTTGCACACATCTTTAGCAAACTCTCTATCACGGACCGATCGCGCACCATTCCTTTCGTCTGCAGATCATGGGCCCGCGCCGCCCGCCATCCGCCATGCTGGGTTTCCATGATCGCCGAAACTCACTCTCCGCCGCCGCATTCCGCCGCCGATCACGCTTTCGTGATGCACTCCCGCCCCGACGCCCTAATTTTTGTTGACCCTTTTGATGGCAGGAGAAGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769194.1
MHQQWEALPSLALAHIFSKLSITDRSRTIPFVCRSWARAARHPPCWVSMIAETHSPPPHSAADHAFVMHSRPDALIFVDPFDGRRSPDPRRGVASFQALIRRAGAAVAAVISVYFFPFLTAGGGPPNDDAILRVIAQCCPNLEHLSFHGSYNASQEAIFEVIHRCNKLELVDFSDSPYFEPVILQELSNCCPRIRGIRRNGGLEPLFSCQLSVGFPLLSMLNVSNSTLVDKDLLKIVDGCKKLCYLDVRGCQFLIFYMHI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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