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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002453`

染色体: Chr06 坐标: 35316586-35319706 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002453`
名称	SmilChr06G002453
描述	uncharacterized SmilChr06G002453
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35316586 - 35319706 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989256`
GeneID	`130989256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989256`
原始查询	`SmilChr06G002453`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WD repeat protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838113]; symbol=AT1G15420; hit=AT1G15420; species=arabidopsis; confidence=high
产物	WD repeat protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838113]; symbol=AT1G15420; hit=AT1G15420; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G15420` (AT1G15420) WD repeat protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838113] identity=58.8; qcov=0.625; evalue=5.31e-59; confidence=high
Rice	`Os12g0634800` - identity=51.4; qcov=0.859; evalue=4.39e-58; confidence=high
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04003 (Utp12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769199.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057769199.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769199.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769199.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769199.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35319019`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B74
`Chr6:35319019`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B74
`Chr6:35319504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:35319506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769199.1

256 aa

128

256

Utp12

PF04003 Utp12 91-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769199.1`	Pfam	`PF04003`	Utp12	Family	91	192	2.5e-16	60.4	Dip2/Utp12 Family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913216.1
TCCAAACAAAAACTAAGACCTAGATCCAGCGCCTTTCTTTCTTCTCTATCGTCTCAGTGCCACCGCCGTCGCCGGTTTGCCCAACTCCCATGTCTCCCAGTCTCTCTCATCTCCTCGTCTCTTGATGCACCGCCGCCCTCGCCAACTCGCCCAACCTTCCCCGTCGCCGGCTTGCCCAACCCCCCTCATCTCTTGAGGCGTCCGCAGCAGTAGCCTCTCTCTAACAGAAATCATGGGAAAGAAGGAAAAATCTTCGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989256
ATGGGAAAGAAGGAAAAATCTTCGAAAAGGAAAAATCGAGAGACGGGAGTAGCCAGTGAGGTCTTGTTTCAGAAGAGTATTGGAGATAAATATAGATTTGATGTTGTGGATGACTTGAGTGAACCAACCATGGGTGAAAAACTTGCAAGCCTCAACTTGGAAGGAAATGACAATGCCCCAAACCCTGAAAATACAGACTCTTCTCTTCCAGCAAAGCCACCTAGTGCAGACTCGGTTAATATCTTAGTTAAGCAAGCACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769199.1
MGKKEKSSKRKNRETGVASEVLFQKSIGDKYRFDVVDDLSEPTMGEKLASLNLEGNDNAPNPENTDSSLPAKPPSADSVNILVKQALHADDRALLIDCLYRQDEKVIANSLSLLNPSDVLKFLKSLVPIIQLRGAVLACALPWLKSLLLQHSSSIMSQESSLAVLNSLFQIIESRVSTFNPALQLSSCLDLLYADSVDDGVEENDIIAPVIYEDEDESDDDASEDSSMEVDTVADGEEPIIYSDISDGEEDGEISD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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