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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002464`

染色体: Chr06 坐标: 35471081-35474045 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002464`
名称	SmilChr06G002464
描述	uncharacterized SmilChr06G002464
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35471081 - 35474045 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989265`
GeneID	`130989265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989265`
原始查询	`SmilChr06G002464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cilia/flagella-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820410]; symbol=BUG22; hit=AT3G12300; species=arabidopsis; confidence=high
产物	cilia/flagella-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820410]; symbol=BUG22; hit=AT3G12300; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G12300` (BUG22) cilia/flagella-associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820410] identity=87.8; qcov=0.756; evalue=4.44e-128; confidence=high
Rice	`Os09g0510200` - identity=86; qcov=0.684; evalue=6.14e-113; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05018 (CFA20_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769202.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057769202.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769202.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769202.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769202.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35471123`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	62	A15,A2,A24,A9,B103,B106,B115,B119,B125,B127,B128,B130,B132,B133,B139,B17,B18,B19,B26,B27,B3,B30,B38,B41,B42,B43,B45,B53,B55,B57,B58,B62,B63,B66,B70,B73,B74,B81,B88,B89,B94,B97,B98,C1,C13,C17,C19,C26,C30,C35,C4,C41,C43,C46,C67,C72,C74,C75,C77,C79,C80,D6
`Chr6:35471144`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B38
`Chr6:35471144`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B38
`Chr6:35471174`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A10,A11,B12,B138,B32,B91,B95,C73,C86
`Chr6:35471227`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B103,B119,B130,B42,B53,B58,B63,B70,B81,B88,C26,C4,C74,C80
`Chr6:35471538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C20
`Chr6:35471571`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A20,B100,B106,B129,B140,B15,B24,B47,B97,C13,C21,C22,C29,C60,C61,D7
`Chr6:35471615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B27
`Chr6:35472329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr6:35472395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr6:35473353`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D4
`Chr6:35473353`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769202.1

250 aa

125

250

CFA20_dom

PF05018 CFA20_dom 60-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769202.1`	Pfam	`PF05018`	CFA20_dom	Domain	60	243	6.3e-90	300.6	CFA20 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913219.1
AAACCAAAAACGTGAATGAAGCATAATCATAATCGAATCATAACAAACTACTTATTTCCTTGCGTGAAAAATAAAGGGGTAATTTATCTCGTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAACTATTCCTCTCTCCCTCAGCTCTCTCGCTTCCCGAGTTCCCTTTTTTCGTTTTATGCTCCGAAGTAGCAGAGGAGATGTTTAAGAACACATTCCAGTCCGGTTTTCTTTCCATCCTTTACAGCCTGGGGAGTAAGCCTTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989265
ATGAAGCATAATCATAATCGAATCATAACAAACTACTTATTTCCTTGCGTGAAAAATAAAGGGGTAATTTATCTCGTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAACTATTCCTCTCTCCCTCAGCTCTCTCGCTTCCCGAGTTCCCTTTTTTCGTTTTATGCTCCGAAGTAGCAGAGGAGATGTTTAAGAACACATTCCAGTCCGGTTTTCTTTCCATCCTTTACAGCCTGGGGAGTAAGCCTTTGCAAATATGGGATAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769202.1
MKHNHNRIITNYLFPCVKNKGVIYLVALSLSLSKLFLSPSALSLPEFPFFVLCSEVAEEMFKNTFQSGFLSILYSLGSKPLQIWDKEVVNGQVKRLQDDDIQSNVLELVGSNVQSTYITCPADPTATLGIKLPFLVMIVKNTKKYFTFEIHVLDDKNVRRRFRASNFQAVTRVKPFICTMPLKLDEGWNQIQLNLTDLTRRAYGTNYVETLRVQVHANCRLRRIYFSDRLYSEEELPPEFKLYLPMQQKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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