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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002472`

染色体: Chr06 坐标: 35529317-35539553 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002472`
名称	SmilChr06G002472
描述	branched-chain-amino-acid aminotransferase-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35529317 - 35539553 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989271`
GeneID	`130989271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989271`
原始查询	`SmilChr06G002472`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	branched-chain-amino-acid aminotransferase-like protein 1
产物	branched-chain-amino-acid aminotransferase-like protein 1
Arabidopsis	`AT5G27410` (AT5G27410) D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832800] identity=80.4; qcov=0.814; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0106400` - identity=27.2; qcov=0.782; evalue=4.09e-18; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0019752 (carboxylic acid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01063 (Aminotran_4); PF19798 (Sulfotransfer_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769207.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769207.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057769208.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057769208.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35533887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:35533973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:35534716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:35538222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:35538267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B125,B27,B35,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769207.1

453 aa

226

453

Sulfotransfer_5

Aminotran_4

PF19798 Sulfotransfer_5 6-138 aa PF01063 Aminotran_4 188-415 aa

XP_057769208.1

376 aa

188

376

Aminotran_4

PF01063 Aminotran_4 111-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769207.1`	Pfam	`PF19798`	Sulfotransfer_5	Domain	6	138	5.3e-20	72.5	Sulfotransferase domain
`XP_057769207.1`	Pfam	`PF01063`	Aminotran_4	Domain	188	415	2.7e-50	172.1	Amino-transferase class IV
`XP_057769208.1`	Pfam	`PF01063`	Aminotran_4	Domain	111	338	1.7e-50	172.7	Amino-transferase class IV

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913224.1
TATTTACGAAATGTTGATTGTTTAGTGATGATTATAAGTGGAAACCTGTATTGAAGATGACACAGAAGTTCTTGACGAACCCCTATATGCGAACTATTTGCGAGTAACAGGAGATCAAAGGCCTTATAGAGAAGAATTCCTGTCAAAATCGGAATCAGATGGAAATAAGGTTATACGGGAAATCATTTTTGCTCCTGGAGAGAAGACATATAGGTTCTGTAAGCATATAGCTGGTCAATGTCTGCCAGGCCTTACATCGG...

XM_057913225.1
AAATCAATAAATATTGCTCCAGAAATTTCTCATGCAGAGTGTGGTTTCCTTGACTTTTGTTATCTCGTACAAATGAGTGGGTATATCAGGACTATAGATATTTTTCTAGATAGATTGCCTTTCATTCTTGGCTATGTATGTATCGACAAAACAGTCAAATCTGGATCCTTAGTTAATCTTGTATTCTTAATTTTTTACTAGATGAAACCAAGAATCTTATTCTACCAGTGGAATTCCATCCCTTCTCTATGATGTAGGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989271
ATGAAGAGAGGAAAACACTGCATACTGATAAGAAATCCCCTTGACGTGTTGACATCCTACAGCAAGGTTTCTCCCCCATCATTCGCTGTGCTGGGGTATGACAGCTTGGTCTCCATTTACAACGAGCTTCATGATCAAGGAAAATTGCCTCCTGTGATTGATTCAGATTTGCTGCGAGAAGATCCTGAGGCTACATTGCGTCATCTGTGTGGTGATCTTGGTATTCCATTTCAAACTTCTATGCTCAAATGGGAACCTGG...

LOC130989271
ATGCCCAACATATCTTCTTGGCTACATTGCGTCATCTGTGTGGTGATCTTGGTATTCCATTTCAAACTTCTATGCTCAAATGGGAACCTGGACCAAAACCATTTGATGGCATGTGGGCCCCCTATTGGTATAAGAATACACACAAGTCAACAGGTTTTGAACGGCCAAAAAAGTATCCCTCTGGGCTATGTGAGGGGATCATCAAACTGTGCCCAACCTGCTCTCCCTGTTTCTACCAATGAGAAGTTGCTTGTTTGGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769207.1
MKRGKHCILIRNPLDVLTSYSKVSPPSFAVLGYDSLVSIYNELHDQGKLPPVIDSDLLREDPEATLRHLCGDLGIPFQTSMLKWEPGPKPFDGMWAPYWYKNTHKSTGFERPKKYPSSFPSSLYNLLEQTLPFYNLLRGYVRGSSNCAQPALPVSTNEKLLVWVGDQIMPRESAKVSVFDSIVQGGDGVWEGLRVYNGKIFKLEEHLDRLFDSAKALSFSNVPTREQVKEAIFKTLIRNEMFSDVHVRLTLTRGKKVTSG...

XP_057769208.1
MPNISSWLHCVICVVILVFHFKLLCSNGNLDQNHLMACGPPIGIRIHTSQQVLNGQKSIPLGYVRGSSNCAQPALPVSTNEKLLVWVGDQIMPRESAKVSVFDSIVQGGDGVWEGLRVYNGKIFKLEEHLDRLFDSAKALSFSNVPTREQVKEAIFKTLIRNEMFSDVHVRLTLTRGKKVTSGMSPAFNQYGCTLIVLAEWKPPVYDNAKGIILVTATTRRNSPNNLDSKIHHNNLLNNILAKIEGNNADADDAIMLDKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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