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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002473`

染色体: Chr06 坐标: 35561059-35561835 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002473`
名称	SmilChr06G002473
描述	uncharacterized SmilChr06G002473
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35561059 - 35561835 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990831`
GeneID	`130990831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990831`
原始查询	`SmilChr06G002473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G42905` (AT5G42905) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834302] identity=32.7; qcov=0.438; evalue=5.45e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0630250` - identity=29; qcov=0.535; evalue=1.03e-07; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771047.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057771047.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771047.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771047.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771047.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35561149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:35561172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C71
`Chr6:35561177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B101,B44,C74
`Chr6:35561180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B101,B44,C74
`Chr6:35561247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A14,B101,B110,B22,B28,C16
`Chr6:35561248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A6,A8,B103,B30,B34,B38,B4,B63,B72,B83,C15,C19,C44,C57,D5
`Chr6:35561251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr6:35561260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C49
`Chr6:35561267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A6,A8,B103,B30,B34,B38,B4,B58,B63,B72,B74,B83,C15,C19,C44,C57,D5
`Chr6:35561276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:35561329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A19,B4,B80,B83,B85,C3,C34,C38,C78,D6
`Chr6:35561333`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A6,A8,B103,B11,B30,B34,B38,B39,B4,B58,B63,B72,B74,B83,C15,C19,C36,C44,C55,C57,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771047.1

258 aa

129

258

RVT_3

PF13456 RVT_3 109-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771047.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	109	227	4.9e-16	59.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915064.1
ATGGTTCGCTTCTCTATCCACCAGAAGAACAGCAAACAAATTGGTAATTTGTGGAAAGTTGGGGTGGTCTCTCTTCTCTGGAGTCTCTGGTCTCACCGTAACAACGTCATACACAAGGATTTGGCGCCTTCGTGCCACTTGATTATCAAGCAGGTCCGGGTTTTTCTATGTGAAGCTGCCAACAATTTCGACCTTGGTCCTATGGCGAACTCGGTTTCTGATCTCCTCATTCTTAAGAAGTTGTCCATCGCTGGACAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990831
ATGGTTCGCTTCTCTATCCACCAGAAGAACAGCAAACAAATTGGTAATTTGTGGAAAGTTGGGGTGGTCTCTCTTCTCTGGAGTCTCTGGTCTCACCGTAACAACGTCATACACAAGGATTTGGCGCCTTCGTGCCACTTGATTATCAAGCAGGTCCGGGTTTTTCTATGTGAAGCTGCCAACAATTTCGACCTTGGTCCTATGGCGAACTCGGTTTCTGATCTCCTCATTCTTAAGAAGTTGTCCATCGCTGGACAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771047.1
MVRFSIHQKNSKQIGNLWKVGVVSLLWSLWSHRNNVIHKDLAPSCHLIIKQVRVFLCEAANNFDLGPMANSVSDLLILKKLSIAGQPRKPISYLYIAWHLPLPSWIKVNTDGSVREGRIYAGGVFRNSFNDVLGCYHFSGGQGVAFEVELLAIIIAIDSAHRANWERVWFESDSSYVVQLLQSLSETVPWRFKPRWQHALSKLHTFTWRISHIFREGNRSADFLASQVREEGFWPHTIAGLNELIKEDVSIPYFTRFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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