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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002474`

染色体: Chr06 坐标: 35577786-35578736 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002474`
名称	SmilChr06G002474
描述	uncharacterized SmilChr06G002474
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35577786 - 35578736 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990832`
GeneID	`130990832`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990832`
原始查询	`SmilChr06G002474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=31.1; qcov=0.509; evalue=4.77e-23; confidence=low
Rice	`Os09g0268800` - identity=25; qcov=0.544; evalue=4.75e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990832

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771048.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771048.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771048.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771048.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35577811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr6:35577826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:35577868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:35577894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:35577902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B62,C28
`Chr6:35577902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C28
`Chr6:35577915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B67,B95
`Chr6:35577916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B97,C28
`Chr6:35577925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B97,C28
`Chr6:35577944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B17
`Chr6:35577973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B65
`Chr6:35578013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B124,B27,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771048.1

316 aa

158

316

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 116-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771048.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	116	162	1.7e-06	28.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915065.1
ATGGCTTTATGGAAAACCTCAGATGCGATCCGTGTGGTGCCGCTAGGGAAAGGTTTCTTTTCGATAATTTTCGTGAACGAATCTGAGCTTGCTACGGCAAAATCTAGGGCTACTTGGAAATTGAGCAAAGGTATTATTCGGATCAGGGAATGGGTTCCGGATTTTGACTCGTACAAAGAATCATCTGCCCTCTCTCAAGTCTGGTTGAGAATCTATTATCTTCCTCACGAGTACTGGCATCCGGAAGTTATAATCGGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990832
ATGGCTTTATGGAAAACCTCAGATGCGATCCGTGTGGTGCCGCTAGGGAAAGGTTTCTTTTCGATAATTTTCGTGAACGAATCTGAGCTTGCTACGGCAAAATCTAGGGCTACTTGGAAATTGAGCAAAGGTATTATTCGGATCAGGGAATGGGTTCCGGATTTTGACTCGTACAAAGAATCATCTGCCCTCTCTCAAGTCTGGTTGAGAATCTATTATCTTCCTCACGAGTACTGGCATCCGGAAGTTATAATCGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771048.1
MALWKTSDAIRVVPLGKGFFSIIFVNESELATAKSRATWKLSKGIIRIREWVPDFDSYKESSALSQVWLRIYYLPHEYWHPEVIIGIARYVGLPIKLDGFAFAGHVGHFARVLVDMDVSKPIPETLTVDKGTRSFEVEFVYENLPHFCGYCKLAGHNIAQCRRKKQQDNNTEATNPKSLDQPSFKSNHNKTMGKEWQKNKEIPIGNSFDALSKELTGAEDFNEGTLLENERTSMISASEHFNRNPAEEFRHTDGAQISPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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