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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002480`

染色体: Chr06 坐标: 35641756-35646618 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002480`
名称	SmilChr06G002480
描述	probable protein phosphatase 2C 60
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35641756 - 35646618 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989279`
GeneID	`130989279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989279`
原始查询	`SmilChr06G002480`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 60
产物	probable protein phosphatase 2C 60
Arabidopsis	`AT4G38520` (AT4G38520) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830009] identity=75.5; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0717800` (OsPP2C60) - identity=77.3; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769218.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769218.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057769218.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769218.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769218.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35642212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:35642234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr6:35642282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr6:35642354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35643351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:35643383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35644576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A20,B103,B51
`Chr6:35644602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A14,C23,C54
`Chr6:35644675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35645431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B59
`Chr6:35645433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35645500`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769218.1

397 aa

198

397

PP2C

PF00481 PP2C 75-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769218.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	75	323	4.6e-39	135.3	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090554.1
TGTTGTTTCTCTCTCTAGATTTCGTATTTACATTATATTTTGGTCTCTCTCTCTTGATTTTCTGTATTTGGAAGAGGGAGTTGTGGAGCCCAAAACTGGTCCTCTGCTTTGCTGGCTTGAAGCTCTCCATTGTTGGTTTTTAATGGGGTTTGTCTGATGAGAGAGACCAGAGTTCAGTTGCCCCAATCAACACACCATAATATTAATAGTAACACCACTTTCTCTTTTTTCTCTTTCTCTACTGCTTCTTCTTCTCTCAC...

XM_057913235.1
TGTTGTTTCTCTCTCTAGATTTCGTATTTACATTATATTTTGGTCTCTCTCTCTTGATTTTCTGTATTTGGAAGAGGGAGTTGTGGAGCCCAAAACTGGTCCTCTGCTTTGCTGGCTTGAAGCTCTCCATTGTTGGTTTTTAATGGGGTTTGTCTGATGAGAGAGACCAGAGTTCAGTTGCCCCAATCAACACACCATAATATTAATAAGAAAAGAGATAGAAGACTAAAGGAACAAAAAACCCTTAGAGGGGAAAGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989279
ATGTTATCCGGGTTAATGAACTTTTTGAGGGCCTGCTTTCGGCCAAGGGCGGATCGTTATGTTCACTCGGGTTCTGATGCAAGTGGGCGTCAAGATGGGCTTCTATGGTATAAGGACTCGGGGCAACATTTTAATGGAGAGTTCTCGATGGCTGTAGTTCAAGCTAATAACTTACTGGAGGATCAGAGCCAACTGGAATCAGGGTGTCTGAGCTCGAATGAGTCAGGTCCATATGGCACGTTTGTGGGTATTTATGATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769218.1
MLSGLMNFLRACFRPRADRYVHSGSDASGRQDGLLWYKDSGQHFNGEFSMAVVQANNLLEDQSQLESGCLSSNESGPYGTFVGIYDGHGGPETSRFINDHLFQHLKRFTGEHQSMSVEVIKKAFQATEDGFFSVVSRQWPLKPQIAAVGSCCLVGIICGGTLYIANLGDSRAVLGRLVKATGEVLAIQLSAEHNASIESVRQELQSLHPDDSHIVVLKHNVWRVKGLIQVSRSIGDVYLKKAEFNREPLYQKFRLREPFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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