当前解析结果
SmilChr06G002484| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002484 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002484 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002484 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 35679582 - 35680058 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990835 |
|---|---|
| GeneID | 130990835 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990835 |
| 原始查询 | SmilChr06G002484 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990835 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057771050.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771050.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771050.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771050.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771050.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:35679589 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B38,C44,C72 |
Chr6:35679597 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,B38,C44 |
Chr6:35679605 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,B37,B45,B87 |
Chr6:35679635 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr6:35679663 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B87 |
Chr6:35679666 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,C28 |
Chr6:35679671 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B73,C43,C72,C78 |
Chr6:35679723 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B119,B65,B85,B87 |
Chr6:35679776 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B17,B74,C43,C72 |
Chr6:35679780 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B3,B73,B78,C11 |
Chr6:35679810 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B119,B65,C18 |
Chr6:35679819 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。