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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002485`

染色体: Chr06 坐标: 35700648-35701491 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002485`
名称	SmilChr06G002485
描述	uncharacterized SmilChr06G002485
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35700648 - 35701491 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990836`
GeneID	`130990836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990836`
原始查询	`SmilChr06G002485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=24.7; qcov=1.01; evalue=6.96e-17; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771051.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057771051.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771051.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771051.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35700671`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A13,A16,B111,B117,B121,B128,B129,B131,B26,B3,B43,B52,B66,B69,B73,B75,B78,B90,B91,B92,B96,C1,C14,C19,C30,C35,C39,C46,C47,C48,C73,C80,C85
`Chr6:35700674`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A13,A16,B111,B117,B121,B128,B129,B131,B26,B3,B43,B52,B66,B69,B73,B75,B78,B90,B91,B92,B96,C1,C14,C19,C30,C35,C39,C46,C47,C48,C73,C80,C85
`Chr6:35700686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B70,C81,D5
`Chr6:35700687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B123,B138
`Chr6:35700703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:35700704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B70,C81,D5
`Chr6:35700716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B123,C87
`Chr6:35700716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C87
`Chr6:35700735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C81
`Chr6:35700761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:35700781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B140,C81,D5
`Chr6:35700794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B140,C81,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771051.1

265 aa

132

265

rve

PF00665 rve 7-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771051.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	7	100	2.6e-13	50.8	Integrase core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915068.1
ATGCCCGTAGAGATATTTGACATATGGGGCATGGATTTCATGGGGCCTTTGCCCTCATCAAAAGAAAATCAGTACATCTTATTGGCTGTGGATTACGTATCCAAATGGATGGAAGCAAAAGCATCGACAACCAATGATTCGAAAGTGGTGGCTTCCTTCTTGAAGTCTAATATCTTTAGCAGGTTCGACATGCTCAAAGCGATCATCAGTGATCAAGGGACACACTTTTGCAATGCAACCATTGAGAAGCTGTTCAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990836
ATGCCCGTAGAGATATTTGACATATGGGGCATGGATTTCATGGGGCCTTTGCCCTCATCAAAAGAAAATCAGTACATCTTATTGGCTGTGGATTACGTATCCAAATGGATGGAAGCAAAAGCATCGACAACCAATGATTCGAAAGTGGTGGCTTCCTTCTTGAAGTCTAATATCTTTAGCAGGTTCGACATGCTCAAAGCGATCATCAGTGATCAAGGGACACACTTTTGCAATGCAACCATTGAGAAGCTGTTCAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771051.1
MPVEIFDIWGMDFMGPLPSSKENQYILLAVDYVSKWMEAKASTTNDSKVVASFLKSNIFSRFDMLKAIISDQGTHFCNATIEKLFKKYEVTHKVTTAYHPQGNGQSELSNRIINTILRKAVGPTGKDWCMRLDDALWAYCTALKTPMRISPYRIIFGKMCPSFSETGAQGQERKLQLQELEEIRREAYDNAALYKERLKRAYDQLIKVKTFENGQKVLLYQSRFKLMSGKLSSKWIGPYEVQAQYPNGAVEIKDFKFGSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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