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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002492`

染色体: Chr06 坐标: 35804728-35810919 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002492`
名称	SmilChr06G002492
描述	uncharacterized SmilChr06G002492
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35804728 - 35810919 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989289`
GeneID	`130989289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989289`
原始查询	`SmilChr06G002492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Splicing factor, CC1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816197]; symbol=AT2G16940; hit=AT2G16940; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Splicing factor, CC1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816197]; symbol=AT2G16940; hit=AT2G16940; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G16940` (AT2G16940) Splicing factor, CC1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816197] identity=55.1; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0439600` - identity=65.8; qcov=0.577; evalue=1.89e-141; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006397 (mRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF15519 (RBM39linker)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769230.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.80000	`XP_057769230.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057769230.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769230.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35805426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C45
`Chr6:35805591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:35807223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:35807237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C43,C70
`Chr6:35807662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C45,C52
`Chr6:35809781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:35810464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769230.1

593 aa

296

593

RRM_1

RBM39linker

RRM_1

PF00076 RRM_1 242-301 aa PF00076 RRM_1 335-405 aa PF15519 RBM39linker 425-515 aa PF00076 RRM_1 521-573 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769230.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	242	301	1e-41	141.4	RNA recognition motif
`XP_057769230.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	335	405	1e-41	141.4	RNA recognition motif
`XP_057769230.1`	Pfam	`PF15519`	RBM39linker	Domain	425	515	4.8e-20	72.8	linker between RRM2 and RRM3 domains in RBM39 protein
`XP_057769230.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	521	573	1e-41	141.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913247.1
TATAATTTAATTTATAGACCTTTTAATTTATTACATTTATTTATAAAAACAAAAATCGGCTGCAGCGCTCCTCAAACTCACTCCGATTTTTGATTATTGCGCAGTTTTATGCGAGCTTCTTAAATTTAGCTTGTTGAAGGATGGAGTTTGATGAATATGAATACCTAGAAAATACAGTGGAGAATCCAGAAGTTAAGAAATTGGAAGGGAAGGCGAATGGTGATGGGAAAGGTGATTATGAGGAGAAAGATAGGAGTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989289
ATGGAGTTTGATGAATATGAATACCTAGAAAATACAGTGGAGAATCCAGAAGTTAAGAAATTGGAAGGGAAGGCGAATGGTGATGGGAAAGGTGATTATGAGGAGAAAGATAGGAGTCGGAGCTCGAAGCGCAGAAGCGTTGAGGATGATGGGGATGATTTAGATCACCCGTCAAAGCCGTCGAGGTCGAGGAATGAGTCTTATGACCATGAGAAAGATAGGGGCGCACGCTATGGCTCATCTTCAAGAGATAGGGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769230.1
MEFDEYEYLENTVENPEVKKLEGKANGDGKGDYEEKDRSRSSKRRSVEDDGDDLDHPSKPSRSRNESYDHEKDRGARYGSSSRDRERGERGERGERGERGDRGERGERDRHTGIREHRTRDKDENSGKERNRDRERDSDKKRNGNRERRERDNERDKIKEEEQERSKRSRNHSERHHEERTREKSKDVENAEPEFKPRERVFRNQDRGDNRRYKDKKEDKVEPEVDPERDQRTVFAYQITLKAGERDIYEFFSRAGKVRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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