当前解析结果
SmilChr06G002495| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002495 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002495 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002495 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 35826865 - 35828517 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130989292 |
|---|---|
| GeneID | 130989292 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989292 |
| 原始查询 | SmilChr06G002495 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989292 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057769234.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057769234.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057769234.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057769234.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769234.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:35826985 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B62 |
Chr6:35827018 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B62 |
Chr6:35827077 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,B32 |
Chr6:35827084 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,B32 |
Chr6:35827119 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B62 |
Chr6:35827131 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B131 |
Chr6:35827131 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr6:35827151 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B62 |
Chr6:35827230 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 60 | A1,A14,A15,A2,A20,A21,A4,B100,B104,B106,B107,B109,B118,B122,B131,B133,B135,B136,B140,B15,B24,B33,B35,B40,B47,B56,B63,B66,B73,B83,B85,B91,B94,B96,B97,B98,B99,C13,C14,C19,C2,C21,C22,C23,C29,C32,C33,C37,C40,C54,C59,C60,C68,C74,C75,C77,C82,C83,C85,D7 |
Chr6:35827266 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr6:35827277 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B78,C58,C62,C84 |
Chr6:35827315 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。