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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002496`

染色体: Chr06 坐标: 35832309-35835274 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002496`
名称	SmilChr06G002496
描述	uncharacterized SmilChr06G002496
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35832309 - 35835274 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989294`
GeneID	`130989294`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989294`
原始查询	`SmilChr06G002496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GCIP-interacting family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816187]; symbol=AT2G16860; hit=AT2G16860; species=arabidopsis; confidence=high
产物	GCIP-interacting family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816187]; symbol=AT2G16860; hit=AT2G16860; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G16860` (AT2G16860) GCIP-interacting family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816187] identity=68.3; qcov=1.01; evalue=1.02e-144; confidence=high
Rice	`Os06g0711600` - identity=67.7; qcov=1; evalue=5.45e-142; confidence=high
GO	GO:0000974 (Prp19 complex); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome); GO:0071014 (post-mRNA release spliceosomal complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08231 (SYF2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989294

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769238.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057769238.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769238.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769238.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769238.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35833567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:35834896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B12,B32,C73,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769238.1

303 aa

152

303

SYF2

PF08231 SYF2 149-296 aa

XP_057769239.1

303 aa

152

303

SYF2

PF08231 SYF2 149-296 aa

XP_057769240.1

303 aa

152

303

SYF2

PF08231 SYF2 149-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769238.1`	Pfam	`PF08231`	SYF2	Domain	149	296	9.4e-36	124.2	SYF2 splicing factor
`XP_057769239.1`	Pfam	`PF08231`	SYF2	Domain	149	296	9.4e-36	124.2	SYF2 splicing factor
`XP_057769240.1`	Pfam	`PF08231`	SYF2	Domain	149	296	9.4e-36	124.2	SYF2 splicing factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913256.1
CGTAGTATGAGGCCCATGTTTCCCAGCCCAAATCGAATGACGGTGCAATGACTCCTTCACGAAAAATTCGCATTATTTATTTCCATAATCTCAAATTTGCACAAGCATCAAACCCTCGCGCCCTAAATTCGATAGCATAAACCAGAGGTATTTTATACTATTATCTGATTACGGAGAATAAGGGAGGATAGTATGGCTGAAGAGAGAGCAGTTCATCCGGATTGCAGAAATGCGTCGAATCTATATCACGAATGTAGTGA...

XM_057913255.1
GTAGTATGAGGCCCATGTTTCCCAGCCCAAATCGAATGACGGTGCAATGACTCCTTCACGAAAAATTCGCATTATTTATTTCCATAATCTCAAATTTGCACAAGCATCAAACCCTCGCGCCCTAAATTCGATAGCATAAACCAGAGTCCTCTATTATGCAGGTATTTTATACTATTATCTGATTACGGAGAATAAGGGAGGATAGTATGGCTGAAGAGAGAGCAGTTCATCCGGATTGCAGAAATGCGTCGAATCTATAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130989294
ATGGCTGAAGAGAGAGCAGTTCATCCGGATTGCAGAAATGCGTCGAATCTATATCACGAATGTAGTGATTATTGCTTCAGAGTTATTGCTGAAGCGAACCTGAACGCGAATGCAGGCGTGGATGCTAATTATCAGGAGCCAAGGCTGGTGGCTGGGCCAGATCAGCAAGAAGAACAGGATGCTGGAAATGATGCCCCCAAGGAGCATTCTGATGGGGAGGTTGATGGGAATGGTGATGATGCTTTAGTTGATTTTGCAAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057769238.1
MAEERAVHPDCRNASNLYHECSDYCFRVIAEANLNANAGVDANYQEPRLVAGPDQQEEQDAGNDAPKEHSDGEVDGNGDDALVDFANLTGRQKKLFELRMKMNEARKANQTAMVAEKKKMEAPTEARGVSKQKWLEERKKKIGKLLDANGLDMSKAYMLDTQEMAESKYKKWEKEPAPAGWDVFNQKTLYDAHNKRTKNIVVDLEAYNRQKEEDPEFYRGASSLQYGKTPNIPAEKIDKMVKELTSREDKSRSFSRRRKY...

XP_057769239.1
MAEERAVHPDCRNASNLYHECSDYCFRVIAEANLNANAGVDANYQEPRLVAGPDQQEEQDAGNDAPKEHSDGEVDGNGDDALVDFANLTGRQKKLFELRMKMNEARKANQTAMVAEKKKMEAPTEARGVSKQKWLEERKKKIGKLLDANGLDMSKAYMLDTQEMAESKYKKWEKEPAPAGWDVFNQKTLYDAHNKRTKNIVVDLEAYNRQKEEDPEFYRGASSLQYGKTPNIPAEKIDKMVKELTSREDKSRSFSRRRKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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