当前解析结果
SmilChr06G002498| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002498 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002498 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002498 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 35865010 - 35870034 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130989293 |
|---|---|
| GeneID | 130989293 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989293 |
| 原始查询 | SmilChr06G002498 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0526000; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os02g0526000; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G47900 (AT5G47900)heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase-like protein (DUF1624) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834841] identity=52.3; qcov=0.992; evalue=1.49e-130; confidence=high |
| Rice | Os02g0526000- identity=52.5; qcov=0.992; evalue=1.27e-142; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989293 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057769237.1 |
| 2 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.60000 | XP_057769235.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057769237.1 |
| 4 | Endosome | 内体 | 0.20000 | XP_057769235.1 |
| 5 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057769237.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:35865759 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:35866150 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B13,C45,C52 |
Chr6:35866807 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B52 |
Chr6:35866807 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr6:35866822 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B125,B34,C85,C87 |
Chr6:35866841 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C40 |
Chr6:35867131 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C59 |
Chr6:35867134 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr6:35867711 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C23 |
Chr6:35867933 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr6:35868745 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B34,B47,C85 |
Chr6:35868748 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。