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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002499`

染色体: Chr06 坐标: 35875595-35877616 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002499`
名称	SmilChr06G002499
描述	SKP1-like protein 1A
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35875595 - 35877616 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989297`
GeneID	`130989297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989297`
原始查询	`SmilChr06G002499`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SKP1-like protein 1A
产物	SKP1-like protein 1A
Arabidopsis	`AT1G20140` (SK4) SKP1-like 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838604] identity=71.6; qcov=0.982; evalue=1.02e-81; confidence=high
Rice	`Os09g0539500` (OSK20) - identity=69.5; qcov=1.05; evalue=1.47e-74; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0097602 (cullin family protein binding)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01466 (Skp1); PF03931 (Skp1_POZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769242.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769242.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057769242.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769242.1`
5	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057769242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35875900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:35877192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C87
`Chr6:35877251`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr6:35877251`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11
`Chr6:35877330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:35877375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769242.1

165 aa

165

Skp1_POZ

Skp1

PF03931 Skp1_POZ 10-69 aa PF01466 Skp1 116-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769242.1`	Pfam	`PF03931`	Skp1_POZ	Domain	10	69	6e-29	100.7	Skp1 family, tetramerisation domain
`XP_057769242.1`	Pfam	`PF01466`	Skp1	Domain	116	163	6.2e-32	109.9	Skp1 family, dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913259.1
CTGAAACTCGTCTATATATATATCCATACTTCGCAAAAGCGGTTGTACTTGGAAATCGACTTTTTCTCTCTCTATAACAATCTCTCTCTAGGTTTTTGCCAAAATCTCGATAGAATTCCGATATGTCTGGCGCAGACGCCGCGTCTGGGAAGATGATCGTGCTGCAGAGCTCCGACAACGAGACCTTCGTGGTGGAGGAGGCGGTCGCCGTGGAATCGCAGACGATTAAGCACATGATCGAGGACGACTGCGCCGACACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989297
ATGTCTGGCGCAGACGCCGCGTCTGGGAAGATGATCGTGCTGCAGAGCTCCGACAACGAGACCTTCGTGGTGGAGGAGGCGGTCGCCGTGGAATCGCAGACGATTAAGCACATGATCGAGGACGACTGCGCCGACACCAGCATCCCGCTTCCCAACGTCACATCGAAGATCCTCGCGAAGGTTATCGAGTACTGTAGGCGCCACGTGGAAGCCGCCGCTAAGGCCACCGGAGACGGCGCCTCGCTGGGCGGCGATGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769242.1
MSGADAASGKMIVLQSSDNETFVVEEAVAVESQTIKHMIEDDCADTSIPLPNVTSKILAKVIEYCRRHVEAAAKATGDGASLGGDEDLKSFDAEFVKVDQGTLFDLILAANYLNIKSLLDLTCQTVADMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTPEEEEEVRRENAWAFE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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