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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002513`

染色体: Chr06 坐标: 36018022-36022830 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002513`
名称	SmilChr06G002513
描述	uncharacterized SmilChr06G002513
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36018022 - 36022830 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989310`
GeneID	`130989310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989310`
原始查询	`SmilChr06G002513`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	minichromosome maintenance 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816632]; symbol=MCM10; hit=AT2G20980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	minichromosome maintenance 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816632]; symbol=MCM10; hit=AT2G20980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G20980` (MCM10) minichromosome maintenance 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816632] identity=53.2; qcov=0.977; evalue=5.45e-133; confidence=high
Rice	`Os09g0539400` (OsMCM10) - identity=42.9; qcov=0.995; evalue=2.36e-97; confidence=medium
GO	GO:0003688 (DNA replication origin binding); GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006270 (DNA replication initiation); GO:0031298 (replication fork protection complex)
KEGG	-
Pfam	PF09329 (zf-primase); PF22379 (OB_MCM10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769252.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057769252.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057769252.1`
4	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057769252.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769252.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36018397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr6:36018562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,B66,B98
`Chr6:36021436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,B66,B98
`Chr6:36021484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr6:36022201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:36022239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:36022265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769252.1

398 aa

199

398

OB_MCM10

zf-primase

PF22379 OB_MCM10 85-210 aa PF09329 zf-primase 213-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769252.1`	Pfam	`PF22379`	OB_MCM10	Domain	85	210	8.4e-52	175.1	MCM10 OB-fold
`XP_057769252.1`	Pfam	`PF09329`	zf-primase	Domain	213	258	1.2e-13	51.3	Primase zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913269.1
CCAAACCCTAGTTCAATTTCGCTCCCGATTTTCTTCTCAAATCAGACACAAATACAGCAATCAAACGTAGTTAACTCAGTAATCAGCTGAAGACAATGTCGACACCTAACCACCAAGACGATCTCGATCTCCTCCTGTCGCTCGAGGATCGCGTGCTCGAAACGCCGCCAGCTTCTCCGTCAGGGTATTTATCAGATGACGGGAGACCACAGCAAACCGGGCCTGTGGATTTGTCTGCTTTCCGAGACGTAGTGGAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989310
ATGTCGACACCTAACCACCAAGACGATCTCGATCTCCTCCTGTCGCTCGAGGATCGCGTGCTCGAAACGCCGCCAGCTTCTCCGTCAGGGTATTTATCAGATGACGGGAGACCACAGCAAACCGGGCCTGTGGATTTGTCTGCTTTCCGAGACGTAGTGGAAGATTGTCTTGATTATGATGCTAAAGATGCCAGGAGAGCTCATAACTCTGAGAAGAGCAAGAGCAAAAGCTCAAAAGAGATTGAAGTTGAGAAGTTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769252.1
MSTPNHQDDLDLLLSLEDRVLETPPASPSGYLSDDGRPQQTGPVDLSAFRDVVEDCLDYDAKDARRAHNSEKSKSKSSKEIEVEKFSGLRIQNPVVSRVELSNHLSDIKYVQLHTIKNLIRGDTLSGCWATIGVLVEKGAPRMSSIGKTFAIWKVGCLGDETVSLFLFGDAYQKSCDAKIGTIFALFNCSVRKDKPGTFSLSIFSAKHILKLGTSADMGVCQGKGKEGAPCTAVIDKRRRKFCNFHSQNSSKKYTSTRTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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