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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002518`

染色体: Chr06 坐标: 36076813-36078617 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002518`
名称	SmilChr06G002518
描述	MYB-like transcription factor 4
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36076813 - 36078617 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989315`
GeneID	`130989315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989315`
原始查询	`SmilChr06G002518`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MYB-like transcription factor 4
产物	MYB-like transcription factor 4
Arabidopsis	`AT4G38620` (MYB4) myb domain protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830018] identity=60.1; qcov=1.13; evalue=1.02e-98; confidence=high
Rice	`Os09g0538400` (R2R3-MYB) - identity=66.5; qcov=0.992; evalue=4.25e-102; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769259.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769259.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769259.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769259.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36077320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:36077335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr6:36078060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C85,D10
`Chr6:36078065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C87
`Chr6:36078291`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	122	A1,A10,A11,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A8,B100,B102,B103,B104,B11,B112,B117,B118,B119,B12,B120,B124,B125,B127,B133,B135,B138,B139,B14,B17,B18,B2,B20,B25,B27,B31,B32,B34,B35,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B51,B56,B57,B58,B59,B64,B66,B67,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B81,B82,B83,B89,B90,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C12,C13,C16,C18,C20,C21,C22,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C37,C4,C40,C41,C42,C48,C5,C51,C52,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C63,C65,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C85,C86,C87,D1,D10,D3,D4,D5,D9
`Chr6:36078293`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	128	A1,A10,A11,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A8,B100,B102,B103,B104,B11,B112,B117,B118,B119,B12,B120,B124,B125,B127,B133,B135,B138,B139,B14,B17,B18,B2,B20,B25,B27,B29,B31,B32,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B46,B51,B57,B58,B59,B63,B64,B66,B67,B68,B7,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B81,B82,B83,B89,B90,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C12,C13,C16,C18,C20,C21,C22,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C37,C4,C40,C41,C42,C48,C5,C51,C52,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C63,C65,C7,C70,C71,C73,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C85,C86,C87,D1,D10,D3,D4,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769259.1

238 aa

119

238

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-76 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-111 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769259.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	3.4e-37	127.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057769259.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	76	2.9e-22	79.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057769259.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	111	3.4e-37	127.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057769259.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	116	2.9e-22	79.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913276.1
AGAAAGAAATCGGAGTATAGTATATGATGATGATGATGCTAATAATCATCAAGAGATATATGCTACCAGCCACTCTCTCAAACCTGTCTCACCAACTCACATCTAGAAGAAATTACCCCCTCCCCCCCCACCCCAACCCCACATATAGAGTCAAAACCCTGTATCTATATGTGTGTAAGAGTGTGTGTCTCTATATATACACACACACACAACTCCCCATCAAGTCCATGAAGGGGCTGCTGCTGATCTTCAAGATTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989315
ATGGGACGATCTCCCTGCTGTGAGAAAGCTCACACTAACAAAGGCGCATGGACTAAGGAGGAGGACGACCGGCTGATCGCCTACATCCGCGCCCACGGGGAGGGCTGCTGGCGCTCCCTCCCCAAGGCCGCCGGCCTCCTCCGCTGCGGCAAGAGCTGCCGCCTCCGCTGGATCAACTACCTCCGCCCCGACCTCAAGCGCGGCAACTTCACCGAGGACGAAGACGAGCTCATCATCAAACTCCACAGCCTCTTAGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769259.1
MGRSPCCEKAHTNKGAWTKEEDDRLIAYIRAHGEGCWRSLPKAAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGNFTEDEDELIIKLHSLLGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIRRKLLSRGIDPATHRAVNEPPEAKTISFSPKEEAVMRERECSPPPVKREKCPDLNLELRISPPYQQNIQTESGTLCFACSTMGIHKTKDCSCGTDNNNNINININGSSSYNSGYDFLGLKGWSFRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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