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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002523`

染色体: Chr06 坐标: 36193954-36197836 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002523`
名称	SmilChr06G002523
描述	uncharacterized SmilChr06G002523
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36193954 - 36197836 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989320`
GeneID	`130989320`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989320`
原始查询	`SmilChr06G002523`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plasma-membrane choline transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830020]; symbol=AT4G38640; hit=AT4G38640; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Plasma-membrane choline transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830020]; symbol=AT4G38640; hit=AT4G38640; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G38640` (AT4G38640) Plasma-membrane choline transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830020] identity=65.7; qcov=0.922; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0580100` - identity=27.2; qcov=0.311; evalue=1.16e-08; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF04515 (Choline_transpo)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989320

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057769266.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057769266.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769266.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769266.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769266.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36194264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B91,C82
`Chr6:36194291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,B66,B98
`Chr6:36194341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B139,B32,C4
`Chr6:36195242`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B57,B90,B92
`Chr6:36195242`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B57,B90,B92
`Chr6:36195371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B59,B78,C17
`Chr6:36195486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B59,B78,C17
`Chr6:36196521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr6:36196884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B59,B78,C17
`Chr6:36196981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B12,B139,B57,C23
`Chr6:36196982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B57,C23
`Chr6:36197206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769266.1

591 aa

296

591

Choline_transpo

PF04515 Choline_transpo 246-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769266.1`	Pfam	`PF04515`	Choline_transpo	Family	246	555	4.5e-72	243.7	Plasma-membrane choline transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913283.1
CATAATTTACAAAAATTAGATAATTATGAGAAATGGCGATAGGAAGTAGACATTGTCGGTTAATTTTTTACTAAAATTTTTACTTTTTGGAGCAAAAAAAAGAAAAATTGAATTAGGACAAGTATGAAATCACGATCCCCAATTCCCATGTCAAATGCAGTAGTCAAACAATCCGACAATCGCACCGCCACCATCTCCGCCGCGTCGCCGCCATGGACACCACCCCCGAGGAGTCATCCTCCACCGCCGCCCATCACGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989320
ATGGACACCACCCCCGAGGAGTCATCCTCCACCGCCGCCCATCACGATCCCGCAGCCACGGCCACGCAGCCCCTCCTCTCTAAACCATATCCCACTCTTGAACCACCCATAGCTTCCATCTCCGAAGCTGAGGAAGACCAAGCCCAATACCTCCAGATCTCCTACAATTACGGCCCTCGCTCCCTCAAAGACCTCCCCTTCCTCATCCTCTTCTCTCTCCTCCTCCTCTCCACCTTCGCCTTCGGAATCTTCGCCTCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769266.1
MDTTPEESSSTAAHHDPAATATQPLLSKPYPTLEPPIASISEAEEDQAQYLQISYNYGPRSLKDLPFLILFSLLLLSTFAFGIFASVNRNPHRHELSYFTYDAASSSCVSVRVRSPFSPSSSNSTISNQFEVLHSNSPNSPNWNAVASLVYYSSDLGGRFNWLNSSDASVLESLIWTLVVTLILSVPFMFLVLLLLKHYTKQIVYASLPFFVIVPIFVNVYWFVACTVSSTCSEAFPLAYRIFVLIFVFLIIGVIVWIFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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