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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002528`

染色体: Chr06 坐标: 36294043-36297046 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002528`
名称	SmilChr06G002528
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36294043 - 36297046 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989326`
GeneID	`130989326`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989326`
原始查询	`SmilChr06G002528`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 5-like
Arabidopsis	`AT4G38650` (AT4G38650) Glycosyl hydrolase family 10 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830021] identity=58.6; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0304900` - identity=58.5; qcov=0.846; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989326

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057769270.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057769270.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769270.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769270.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769270.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36294772`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A18,A21,B2,B28,B79,B82,C18,C37,C87,D4,D5
`Chr6:36294932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B42,B60,C14,D1
`Chr6:36295156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B64,B66,B98,D10
`Chr6:36295198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:36295468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B68,B83,C12,C75
`Chr6:36295476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr6:36295719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C5,C52
`Chr6:36296030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B64,B66
`Chr6:36296078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B59,B78
`Chr6:36296215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B131,C59
`Chr6:36296281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:36296324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B42,B43,C14,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769270.1

552 aa

276

552

Glyco_hydro_10

PF00331 Glyco_hydro_10 206-466 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769270.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	206	466	2.3e-43	149.3	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913287.1
CGCGTTGAGGAGTTTGGTCGAGGAGATTGGCCCGGCCTCGCCTCAAGAACACTTGTACTTGCAGCACAACTTCTAGAATCGACTCAACGGCCCGTGAGACGTGGCGTGTCGTTGCCAATCACTAACATGGAAATGGAAGTGGTAAGAGAGCATGAAAAGTTTACTGTTCGTTTCGTTATCGGGTCTCCTCCTCCTCCTCGGAGCTACTGCTTTCTCGAGGGAAGGGCCTTCCTATGATTACTCTGCAAGTATTGAGTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989326
ATGAAAAGTTTACTGTTCGTTTCGTTATCGGGTCTCCTCCTCCTCCTCGGAGCTACTGCTTTCTCGAGGGAAGGGCCTTCCTATGATTACTCTGCAAGTATTGAGTGCAAATCAGCACCGGATGATCCGCTCTACAACGGTGGCATCATCAAGAACCAGACTCTTGGAACGAGAAGGTACCGCCACTTCAACGTCCCGATGAATTCCCCTGCTTTCGCCTTGAGCAATCTCACCGGTGACACGATCTACACCTTCTCCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769270.1
MKSLLFVSLSGLLLLLGATAFSREGPSYDYSASIECKSAPDDPLYNGGIIKNQTLGTRRYRHFNVPMNSPAFALSNLTGDTIYTFSSWVKISGADSAAIKATLTTDNTTFACMGTVIARSGCWSFLKGGFSLDSPSNYALIYFQNSDDLQQINISVSSASLQPFTSQQWKANQQNMISTERKRAAILHVSDVNGKRLSGATVVVEQISRDFPFGSAIAKTILGNSPYQDWFVERFNAAVFENELKWGATEPRQGEVNYTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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