当前解析结果
SmilChr06G002529| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002529 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002529 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002529 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 36298212 - 36299611 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990841 |
|---|---|
| GeneID | 130990841 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990841 |
| 原始查询 | SmilChr06G002529 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=35.8; qcov=0.332; evalue=1.74e-12; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990841 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771056.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057771056.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771056.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771056.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771056.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:36298219 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 17 | B100,B106,B118,B140,B15,B24,B40,B47,B67,C13,C21,C29,C40,C60,C61,C63,D7 |
Chr6:36298316 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr6:36298491 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | A11,A24,B102,B20,B35,B46,B66,B94,C33,C42,C58 |
Chr6:36298795 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr6:36298966 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr6:36298985 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr6:36299027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr6:36299206 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr6:36299262 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,C2,C48 |
Chr6:36299281 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,C2,C48 |
Chr6:36299304 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr6:36299307 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A16,C48 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。