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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002533`

染色体: Chr06 坐标: 36341936-36342988 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002533`
名称	SmilChr06G002533
描述	glycine-rich protein 2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36341936 - 36342988 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989330`
GeneID	`130989330`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989330`
原始查询	`SmilChr06G002533`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich protein 2
产物	glycine-rich protein 2
Arabidopsis	`AT2G21060` (GRP2B) glycine-rich protein 2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816641] identity=51.9; qcov=1; evalue=5.71e-32; confidence=medium
Rice	`Os02g0121100` (OsCSP1) - identity=60.9; qcov=1; evalue=9.41e-41; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF00313 (CSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989330

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769275.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769275.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057769275.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769275.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36342595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C56
`Chr6:36342599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:36342609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr6:36342622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B17,C70
`Chr6:36342641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,B87,C55,C7
`Chr6:36342649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A11,B102,B132,B20,B26,B65,B70,B93,B99,C23,C33,C36,C39,C51,C58,C71,D3,D4
`Chr6:36342650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B66,C32,C68
`Chr6:36342658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr6:36342661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D1
`Chr6:36342672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr6:36342685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr6:36342696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769275.1

214 aa

107

214

CSD

zf-CCHC

PF00313 CSD 8-72 aa PF00098 zf-CCHC 156-171 aa PF00098 zf-CCHC 195-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769275.1`	Pfam	`PF00313`	CSD	Domain	8	72	6.9e-27	93.8	'Cold-shock' DNA-binding domain
`XP_057769275.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	156	171	6.5e-16	58.3	Zinc knuckle
`XP_057769275.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	195	211	6.5e-16	58.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913292.1
AAATATATATAGTCACGCCTCTGTGCAAGCCCTTATACAAAGGTTTAGATAGAGAAAGGGTTACCATTTAGAGAGAGAGTGAGAAATTAGGGTTTTGGGAGAAAAATGGCGGACGGCGATCTGAAGAAGGGGTGTGTGAAGTGGTTCAACGATCAGAAAGGCTTCGGCTTCATCACCCCCGACGACGGCAGCGAGGATCTGTTCGTCCACCAATCCGCCATCAAATCCGACGGATTCCGCAGCCTCGGCGACGGCGAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989330
ATGGCGGACGGCGATCTGAAGAAGGGGTGTGTGAAGTGGTTCAACGATCAGAAAGGCTTCGGCTTCATCACCCCCGACGACGGCAGCGAGGATCTGTTCGTCCACCAATCCGCCATCAAATCCGACGGATTCCGCAGCCTCGGCGACGGCGAGGTTGTGGAGTACACGGTCGAGATCGGCAACGACGGACGCGCCAAGGCGGCCAACGTGACCGGACCTGACGGCGTATCTGTGCAGGGCAGCACCCGCGGCGGAGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769275.1
MADGDLKKGCVKWFNDQKGFGFITPDDGSEDLFVHQSAIKSDGFRSLGDGEVVEYTVEIGNDGRAKAANVTGPDGVSVQGSTRGGGGGGGGGGSYGGRGGGGGYNGGGSRGGSRGYGGGGSYGGGGSYGGSGGYGGGGGGYGGGGGGYGGGGGGSGCFKCGENGHMARECPTGGGGGGGGRYSGGGGGGGGGGGGCYNCGEDGHFARECPNNNR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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