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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002557`

染色体: Chr06 坐标: 36755257-36756214 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002557`
名称	SmilChr06G002557
描述	uncharacterized SmilChr06G002557
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36755257 - 36756214 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990848`
GeneID	`130990848`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990848`
原始查询	`SmilChr06G002557`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G05642` (AT2G05642) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430] identity=29.6; qcov=0.545; evalue=2.48e-09; confidence=low
Rice	`Os03g0214100` (OsRPA1) - identity=30.8; qcov=0.394; evalue=3.02e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990848

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771061.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771061.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771061.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771061.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36755368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr6:36755377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:36755488`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C45,C5,C52
`Chr6:36755488`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C45,C5,C52
`Chr6:36755489`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	C45,C5,C52
`Chr6:36755489`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	C45,C5,C52
`Chr6:36755525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B37,D8
`Chr6:36755708`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A1,A14,A21,B100,B133,B63,B83,B88,C21,C23,C38,C54,C83
`Chr6:36755733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C5,C52
`Chr6:36755848`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B34,B91
`Chr6:36755848`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B34,B91
`Chr6:36755900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771061.1

198 aa

198

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 9-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771061.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	9	108	6.4e-15	55.9	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915078.1
ATGGATCATGTCGAAGCGATTGGTGAATGGTGGTATCCGGCTTGCCAGCGTTGTGGCAAAAAAGTAATGAAAGTTGACAACAAGTTCTATTGTGATCGTTGCAAGAAATATGATGGGCTGCCCAACAAGAGATTCATGTTGAAGGTCAATGTCATTGATGCCAGTAGCAATGCTACTCTACTGCTGTGGGATCGTGAATGCGTTAAGCTTTTGGGTAAAAGAGCTTCTGAAATTGATGGTGTTGGTGTTAAGACAGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990848
ATGGATCATGTCGAAGCGATTGGTGAATGGTGGTATCCGGCTTGCCAGCGTTGTGGCAAAAAAGTAATGAAAGTTGACAACAAGTTCTATTGTGATCGTTGCAAGAAATATGATGGGCTGCCCAACAAGAGATTCATGTTGAAGGTCAATGTCATTGATGCCAGTAGCAATGCTACTCTACTGCTGTGGGATCGTGAATGCGTTAAGCTTTTGGGTAAAAGAGCTTCTGAAATTGATGGTGTTGGTGTTAAGACAGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771061.1
MDHVEAIGEWWYPACQRCGKKVMKVDNKFYCDRCKKYDGLPNKRFMLKVNVIDASSNATLLLWDRECVKLLGKRASEIDGVGVKTGDSCNIPKEIQRSFFRRICITLEIIEKHAADFVESLNDVKSQNDYAKSLSDISFQLKQIPVSETIEAHGGDFEKILEEGHDLIETGKMKIDNLFDQSVKVKKVKLKEVKVEKE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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