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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002559`

染色体: Chr06 坐标: 36761610-36763474 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002559`
名称	SmilChr06G002559
描述	chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36761610 - 36763474 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989353`
GeneID	`130989353`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989353`
原始查询	`SmilChr06G002559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic-like
产物	chaperone protein dnaJ C76%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G23240` (AT5G23240) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832388] identity=36.6; qcov=0.856; evalue=4.34e-23; confidence=medium
Rice	`Os06g0474800` - identity=51; qcov=1.01; evalue=1.77e-61; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13370 (Fer4_13); PF13459 (Fer4_15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989353

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057769293.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057769293.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769293.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057769293.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769293.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36761992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B107,B64,B66,B98
`Chr6:36761992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,B66,B98
`Chr6:36762086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:36762152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:36762538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74
`Chr6:36762540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:36762811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B110,B75,B98,D11
`Chr6:36762859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B32,C73,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769293.1

201 aa

100

201

Fer4_15

Fer4_13

PF13459 Fer4_15 50-106 aa PF13370 Fer4_13 51-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769293.1`	Pfam	`PF13459`	Fer4_15	Domain	50	106	3.5e-06	28.3	4Fe-4S single cluster domain
`XP_057769293.1`	Pfam	`PF13370`	Fer4_13	Domain	51	106	1.3e-11	45.7	4Fe-4S single cluster domain of Ferredoxin I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913310.1
CTCAAACTAGATATATCTACCAAGACCAAAAAACTATAATTGAGAAAACCAGAAAAATAAAATGTGGGCAGCCTCTCTTTCCCCTCATCAACAATTCTTGAATCCAAACCCTTTCATAACCGATCAACACTGCAATTTCAAGAATTCCTTCTGGTGGAGGAGGCGACGTTCAGTTCGACGCTGTGTTGTGTGAAGAAAGCAGCAGAGGGCAAGAACCATTACGAGTTGCTAGGAGTCTCAGTTGATGCGAGTGGCCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989353
ATGTTGAATAAAGCGTATGAGGTGTTGGTGAGAGACGAACTCAAAAAAGAATACGATAGATCAATTGGCATAGTTCGTTTCGGGTTCGAGATCGAGGGGAGCACGCCCGGTAGTGTGTGGAAAGAGCCCTTGAGACCCCAAGCTCTATTTGTCGATGAAAATGCTTGTGTAGGTTGCTGGAAATGCGTGCACCAAGCGGGCGACACATTCACCATGGACGAAGCTTCTGGAACCGCGCGCGTCAAGGTTCAATACGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769293.1
MLNKAYEVLVRDELKKEYDRSIGIVRFGFEIEGSTPGSVWKEPLRPQALFVDENACVGCWKCVHQAGDTFTMDEASGTARVKVQYGDHYTKIEMSVESCPVNCIHWVDTEELAVLEHLIRPQPKEGYGIYGQGWERPANVFMAAKSFKKKLQQEERQQRQGKSRDEKETPAQAEARENAYKELNIGNFARIWSWLKRSTSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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