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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002602`

染色体: Chr06 坐标: 37377173-37378269 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002602`
名称	SmilChr06G002602
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37377173 - 37378269 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990862`
GeneID	`130990862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990862`
原始查询	`SmilChr06G002602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=28; qcov=0.821; evalue=4.94e-26; confidence=low
Rice	`Os12g0160900` - identity=30.8; qcov=0.735; evalue=4.41e-31; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771073.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771073.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771073.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771073.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771073.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37377191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:37377229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B40,B78,C23,C37
`Chr6:37377265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:37377285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C62
`Chr6:37377381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C37
`Chr6:37377391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B139,B71,C4,C48
`Chr6:37377398`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A20,A9,B10,B123,B127,B19,B28,B36,B72,B99,C10,C3,C51,C56,C65,C75,D1
`Chr6:37377411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B104,B26,B41,B65
`Chr6:37377415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B125,B42,B43,C72
`Chr6:37377428`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A1,A13,A22,A9,B104,B11,B121,B122,B123,B21,B31,B35,B37,B5,B54,B59,B6,B85,B88,B9,C22,C25,C40,C48,C50,C67,C85
`Chr6:37377454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A24,D3
`Chr6:37377456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B22,B24,B26,B41,C2,C35,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771073.1

340 aa

170

340

SWIM

PF04434 SWIM 145-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771073.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	145	170	8.1e-10	38.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915090.1
ATGTATTTGCTACGTAAACGGTGGGCATCGGTTTTCACAAGAGATATCTTCTCTGCTGGGCTATTGGCAACGTCTCGCAGTGAGTCCGCCAACAAAGTGATGAAGGAGATTTGTCGTTCGAGCACGTCGTTATTTGACCTTGTAATTAAGTACGACGGCATACTCCAAAAATGGCGACGTGGAGAACGTGAAGAGGACATGCACTGTAGATGGTTACCTGGCCAATATGTACGAAACAATCCACTTCTGACTCATGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990862
ATGTATTTGCTACGTAAACGGTGGGCATCGGTTTTCACAAGAGATATCTTCTCTGCTGGGCTATTGGCAACGTCTCGCAGTGAGTCCGCCAACAAAGTGATGAAGGAGATTTGTCGTTCGAGCACGTCGTTATTTGACCTTGTAATTAAGTACGACGGCATACTCCAAAAATGGCGACGTGGAGAACGTGAAGAGGACATGCACTGTAGATGGTTACCTGGCCAATATGTACGAAACAATCCACTTCTGACTCATGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771073.1
MYLLRKRWASVFTRDIFSAGLLATSRSESANKVMKEICRSSTSLFDLVIKYDGILQKWRRGEREEDMHCRWLPGQYVRNNPLLTHAASVYTRALYKAFEEEVKASFNVILEEFPGEVGEWLWFNATSTGLRSRPRVIQFNRYSSHATCSCRMWESEGIPCRHIVKVFYLKNVVQIPDDLILKRWTKGAKFGESFPLNDCLHGGTMNYMLFVNKCMRDVYEMATSSKDSEVACSAILEQLANLRLEVSKIVGSPMKPCDGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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