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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002604`

染色体: Chr06 坐标: 37425453-37428835 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002604`
名称	SmilChr06G002604
描述	PWWP domain-containing protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37425453 - 37428835 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989382`
GeneID	`130989382`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989382`
原始查询	`SmilChr06G002604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PWWP domain-containing protein 3-like
产物	PWWP domain-containing protein 3-like
Arabidopsis	`AT5G40340` (AT5G40340) Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834032] identity=49; qcov=0.288; evalue=2.44e-49; confidence=weak
Rice	`Os05g0463500` - identity=52.8; qcov=0.18; evalue=9.94e-39; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00855 (PWWP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989382

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769328.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769328.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769328.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769328.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769328.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37426616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,D10
`Chr6:37426861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B110,B86,D6
`Chr6:37427011`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr6:37427011`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr6:37427085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr6:37427352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,C45,C52
`Chr6:37427497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C26
`Chr6:37427836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D1
`Chr6:37427848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C77,C80,D10
`Chr6:37427856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,D10
`Chr6:37427860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:37427883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769328.1

695 aa

348

695

PWWP

PF00855 PWWP 164-249 aa

XP_057769329.1

695 aa

348

695

PWWP

PF00855 PWWP 164-249 aa

XP_057769330.1

695 aa

348

695

PWWP

PF00855 PWWP 164-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769328.1`	Pfam	`PF00855`	PWWP	Domain	164	249	4.5e-18	66.2	PWWP domain
`XP_057769329.1`	Pfam	`PF00855`	PWWP	Domain	164	249	4.5e-18	66.2	PWWP domain
`XP_057769330.1`	Pfam	`PF00855`	PWWP	Domain	164	249	4.5e-18	66.2	PWWP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913346.1
CAACGAAGCTCTACGCTGAACCGCCAGCTGTCAGTCACGCCTCTTCAACTCTTTATCATTCCCATCCACTTCCACAGAAACCAAGGAATCAACACGCGCTCCGTCCCGCTTCCACGTCGGCAGCCAGATCCGCATCTCTCCAACTCCGGCGAGTAGGAATTCAATTACACACTCTCGCGATTCGGAACGAGAAGCTCAAAACCAGCTCAGAATCACTGATACGAAACACATCACTTCCCTGGGAAAAAGCGTCTCCAAAA...

XM_057913347.1
AACGAAGCTCTACGCTGAACCGCCAGCTGTCAGTCACGCCTCTTCAACTCTTTATCATTCCCATCCACTTCCACAGAAACCAAGGAATCAACACGCGCTCCGTCCCGCTTCCACGTCGGCAGCCAGATCCGCATCTCTCCAACTCCGGCGAGTAGGAATTCAATTACACACTCTCGCGATTCGGAACGAGAAGCTCAAAACCAGCTCAGAATCACTGATACGAAACACATCACTTCCCTGGGAAAAAGCGTCTCCAAAAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130989382
ATGAGTAGGCTGAAAGATACAGTGGCGGCGGAAGAACTTCCTACTGAAGGTTCTGGCAATCTAATGGGTGGGTCTGTTTCTAAACTTGAAGCTATCCGGGTCGGGTCATTGGAAGCAAAGAAAGATGATGGTGGCTCTGTTACTGCAGCATCAGCAGCAATAGTTGATATAGAAAAAGACTTATCTTTTCTAAAAATTGGATTTTGGAATTTGAGCGATGAAGAGTTTGAAGGCACAAGAAGTGTTTCAGATAGTGTTGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057769328.1
MSRLKDTVAAEELPTEGSGNLMGGSVSKLEAIRVGSLEAKKDDGGSVTAASAAIVDIEKDLSFLKIGFWNLSDEEFEGTRSVSDSVVDGRGVLDVDGSSTVVARDEKIIDADFTCTDNTGSGDGMRGRERGTINLNADVSVDGNGVGRWNGERVEDQDHGFRVGDLVWGKIKSHPWWPGQVYDPRDASEFALKHSQEGRVLVAFFGDGSCSWCLPSQLVPFVENFDRMWSDRPLSSRSFVNAVQRAVDEIGRLLESRMTC...

XP_057769329.1
MSRLKDTVAAEELPTEGSGNLMGGSVSKLEAIRVGSLEAKKDDGGSVTAASAAIVDIEKDLSFLKIGFWNLSDEEFEGTRSVSDSVVDGRGVLDVDGSSTVVARDEKIIDADFTCTDNTGSGDGMRGRERGTINLNADVSVDGNGVGRWNGERVEDQDHGFRVGDLVWGKIKSHPWWPGQVYDPRDASEFALKHSQEGRVLVAFFGDGSCSWCLPSQLVPFVENFDRMWSDRPLSSRSFVNAVQRAVDEIGRLLESRMTC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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