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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002608`

染色体: Chr06 坐标: 37498005-37500547 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002608`
名称	SmilChr06G002608
描述	cinnamoyl-CoA reductase-like SNL6
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37498005 - 37500547 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989415`
GeneID	`130989415`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989415`
原始查询	`SmilChr06G002608`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cinnamoyl-CoA reductase-like SNL6
产物	cinnamoyl-CoA reductase-like SNL6
Arabidopsis	`AT5G14700` (AT5G14700) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831322] identity=51.6; qcov=1.04; evalue=1.39e-121; confidence=high
Rice	`Os01g0639200` (SNL6) cinnamoyl-CoA reductase-like SNL6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4326581] identity=50.8; qcov=0.861; evalue=6.9e-102; confidence=high
GO	GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989415

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769397.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769397.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769397.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769397.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769397.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37498172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:37498203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:37498244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A14,B103
`Chr6:37498789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:37498825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,D11
`Chr6:37499343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:37499348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:37499411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B86,D6
`Chr6:37499474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:37500116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:37500265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769397.1

361 aa

180

361

Epimerase

3Beta_HSD

NAD_binding_10

PF01370 Epimerase 57-295 aa PF01073 3Beta_HSD 58-192 aa PF13460 NAD_binding_10 66-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769397.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	57	295	6.5e-09	36.3	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057769397.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	58	192	9.5e-09	35.4	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057769397.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	66	247	2.9e-07	31.2	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913414.1
AATTGTGTCTAGACAACTGTTGTTGTCTAGATAGCTTTATTGTATTTTTTAACTATGTATCTGAACCGACTAAAATTTTCGAGCGAGCCGTCAATGATGAATTGATATAAGCTGAAAAGCCGCTGAGGTGCTTTTTACATGACGGCCCGCTTATTTTTCCAACTGAAACCTATTCCATAAATCTTCTACTTCATTTTTTTTTTTTAATTTTTCAAATTTGATTTTGCCATAAAGAATTTCTGCAGAGCTCGAGCTAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989415
ATGGGGATTGTGAGGCAGGAGGCGACGCAGAAGGCGGAGCTCGAGGAATTCCGCCGTATGCTGCTATCGTGCGCCGCGGTGAACCGGCGGAAGGAAGGCGACGGGCTAGGCGGCGGCAGGGACAGCGCCTTGCCCGCGCGCGGCGGCGACGTATTGGACAGGATGGTCTGCGTCACCAGCGGCGTATCCTATCTCGGCATCGCTATAGTGAACCAGCTCCTAGTCAACGGTTACTCTGTTCGAATCATCGTCGATAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769397.1
MGIVRQEATQKAELEEFRRMLLSCAAVNRRKEGDGLGGGRDSALPARGGDVLDRMVCVTSGVSYLGIAIVNQLLVNGYSVRIIVDNEEDVEKLREMETSGEMRLNNSIVEVVMAKLTEVESLTEAFDGCRGVFHTAAFVDPAGLSGYSKAMAEIEVNTSKNVARACGLSPSVRHCVLTSSLLACIWHDCSSDEAPRLIDHKCWSDEAICVNKKLWYALGKLRAEKAAWEIAKANGVKLTAICPGLITGSDFYRRNPTSTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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