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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002609`

染色体: Chr06 坐标: 37534650-37536875 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002609`
名称	SmilChr06G002609
描述	uncharacterized SmilChr06G002609
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37534650 - 37536875 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990864`
GeneID	`130990864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990864`
原始查询	`SmilChr06G002609`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=32.3; qcov=0.17; evalue=1.17e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771076.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057771076.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771076.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771076.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771076.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37534653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,C63,D10
`Chr6:37534664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B41,B71,C26
`Chr6:37534665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	136	A1,A10,A14,A15,A16,A18,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A7,A9,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B110,B112,B115,B118,B12,B120,B123,B125,B127,B128,B130,B131,B132,B134,B135,B139,B14,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B26,B29,B3,B30,B35,B37,B40,B42,B43,B5,B50,B52,B55,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B73,B75,B79,B8,B80,B82,B84,B86,B87,B89,B94,B96,B98,C1,C10,C12,C13,C18,C19,C20,C21,C23,C24,C25,C27,C3,C30,C32,C33,C38,C39,C4,C41,C42,C45,C48,C49,C52,C54,C56,C57,C58,C60,C63,C64,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C84,C85,C87,D1,D11,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr6:37534668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B114,B121,C54,C82
`Chr6:37534671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A22,A8,B109,B117,B127,B133,B18,B23,B36,B49,B56,B6,B68,B72,B76,B79,B80,B81,B91,B94,B95,C11,C18,C20,C22,C28,C29,C50,C56,C67,C69,C71,C76,C81,D7
`Chr6:37534683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A24,B106,B107,B120,B128,B134,B14,B35,B5,B60,B69,C28,C40,C71,D1
`Chr6:37534688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B41,B71,C26,C28
`Chr6:37534741`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C80
`Chr6:37534741`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C80
`Chr6:37534774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B71,B72,C26
`Chr6:37534785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A4,B123,B53,C28
`Chr6:37534785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B123,B53,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771076.1

546 aa

273

546

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 373-464 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771076.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	373	464	2.1e-05	25.9	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915093.1
ATGGCAGAAGCCGAGCAGGCGCAGACCCTCAAACAGTTGGCATACCCAACTAATCTCAACTTGAGGCCTAACGAGATTACCTTACCAGAGAACCCGTTCGCATCTCGTCGGTATGACCTGAAGCCCTCACTGCTTCAGATCTTACCGAAGTTCAATGGATACCCAGGAGATGATCCTCACACTCATCTGCAAGATTTTGAGATGACGATCATGCACCAGTCAAGACATCAGTCTGAAAATTGCCCTAACTTCGGCGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990864
ATGGCAGAAGCCGAGCAGGCGCAGACCCTCAAACAGTTGGCATACCCAACTAATCTCAACTTGAGGCCTAACGAGATTACCTTACCAGAGAACCCGTTCGCATCTCGTCGGTATGACCTGAAGCCCTCACTGCTTCAGATCTTACCGAAGTTCAATGGATACCCAGGAGATGATCCTCACACTCATCTGCAAGATTTTGAGATGACGATCATGCACCAGTCAAGACATCAGTCTGAAAATTGCCCTAACTTCGGCGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771076.1
MAEAEQAQTLKQLAYPTNLNLRPNEITLPENPFASRRYDLKPSLLQILPKFNGYPGDDPHTHLQDFEMTIMHQSRHQSENCPNFGEDIVDVNAIGGHDGNPHKYDPFSNTYNSGWRDHPNFRWKQDGQPQQQNNMGVPMQRPQYNQNQHQQQYQLGPPQHHNQNQQQPPYQPPHRRAPWEEAIENMVKESEKFCNEIRAGMNQTNQQISHLTKAVAKLEENTGKLPAMGINPREHAQVVLTEFPEGEEKEEELLAEAELI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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