当前解析结果
SmilChr06G002610| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002610 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002610 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002610 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 37539536 - 37540015 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990865 |
|---|---|
| GeneID | 130990865 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990865 |
| 原始查询 | SmilChr06G002610 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990865 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771077.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057771077.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771077.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771077.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771077.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:37539543 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B139,C18 |
Chr6:37539559 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B139,B62,C18,D10 |
Chr6:37539559 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B139,B62,C18,D10 |
Chr6:37539570 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,B48,C12 |
Chr6:37539590 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B128,C22 |
Chr6:37539599 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C16 |
Chr6:37539601 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr6:37539606 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 45 | A14,A16,A18,A19,A23,A9,B110,B119,B124,B125,B131,B135,B16,B20,B36,B38,B39,B40,B51,B57,B6,B75,B8,B87,C16,C20,C22,C24,C28,C32,C33,C35,C46,C47,C52,C54,C56,C65,C67,C68,C71,C74,C76,C86,D4 |
Chr6:37539637 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C14,C25 |
Chr6:37539651 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B16,C48,C63,C81 |
Chr6:37539653 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 28 | A10,A11,A20,B112,B129,B132,B133,B136,B139,B2,B24,B33,B37,B40,B45,B48,B5,B80,B91,B93,C12,C34,C42,C46,C50,C52,C53,C82 |
Chr6:37539671 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B20,B43,C8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。