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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002613`

染色体: Chr06 坐标: 37594213-37596528 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002613`
名称	SmilChr06G002613
描述	uncharacterized SmilChr06G002613
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37594213 - 37596528 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990868`
GeneID	`130990868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990868`
原始查询	`SmilChr06G002613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=37.3; qcov=0.077; evalue=2.92e-06; confidence=weak
Rice	`Os08g0202300` - identity=30.9; qcov=0.231; evalue=7.67e-21; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2); PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771079.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057771079.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771079.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771079.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771079.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37594219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B107
`Chr6:37594219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:37594221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr6:37594248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C12,C62
`Chr6:37594258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C12
`Chr6:37594258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:37594281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B28,B44,C76
`Chr6:37594291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B28,B44,C76
`Chr6:37594295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C62
`Chr6:37594314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:37594332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B77,C62
`Chr6:37594340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B77,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771079.1

771 aa

386

771

Asp_protease_2

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF13650 Asp_protease_2 178-268 aa PF17919 RT_RNaseH_2 604-702 aa PF17917 RT_RNaseH 633-732 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771079.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	178	268	1.3e-06	29.7	Aspartyl protease
`XP_057771079.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	604	702	8.2e-25	87.5	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057771079.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	633	732	4.1e-31	108.0	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915096.1
ATGCAACAGCAGCAACAACCAGGGAAGCTCCATGGGCAAGGATTACAGCCCCACCAAGCCCAAGCTGTCACTGTTTTACGCAGTGGAAAGGTGGTGAACAACAAAGTGGAAGCCCCTGTGGAAGAACCACCCAAGGAAGCCCGCATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCTGCAGCCAAGAGAGGAGGAGAAGGAGAAAGAGCAGGAGCCCGTAGTGAAGCTCCACAAGGCTACCAAGCCATATAAGCCACCGGTCCCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990868
ATGCAACAGCAGCAACAACCAGGGAAGCTCCATGGGCAAGGATTACAGCCCCACCAAGCCCAAGCTGTCACTGTTTTACGCAGTGGAAAGGTGGTGAACAACAAAGTGGAAGCCCCTGTGGAAGAACCACCCAAGGAAGCCCGCATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCTGCAGCCAAGAGAGGAGGAGAAGGAGAAAGAGCAGGAGCCCGTAGTGAAGCTCCACAAGGCTACCAAGCCATATAAGCCACCGGTCCCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771079.1
MQQQQQPGKLHGQGLQPHQAQAVTVLRSGKVVNNKVEAPVEEPPKEARMEEQVKEPLQPREEEKEKEQEPVVKLHKATKPYKPPVPYPSRLKNEKLDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLDVIRNVPAYLKFFKELASKKRRFEDNEKILVSEVANSIMQQPLPTKQRDPGSFVINIALGNGKEASGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGNLKPTRMCLQLADRSVRYPHGVVEDILVRVGGLIVPVDFVVLEIGEVHENGKEH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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