当前解析结果
SmilChr06G002626| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002626 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002626 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002626 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 37817843 - 37825606 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130989406 |
|---|---|
| GeneID | 130989406 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989406 |
| 原始查询 | SmilChr06G002626 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | beta-galactosidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822417]; symbol=AT3G27930; hit=AT3G27930; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | beta-galactosidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822417]; symbol=AT3G27930; hit=AT3G27930; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G27930 (AT3G27930)beta-galactosidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822417] identity=66.2; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os05g0577800- identity=58.4; qcov=0.96; evalue=4.31e-180; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989406 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057769372.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.60000 | XP_057769372.1 |
| 3 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057769372.1 |
| 4 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.40000 | XP_057769372.1 |
| 5 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057769372.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:37819779 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B63 |
Chr6:37819779 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B63 |
Chr6:37823898 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。