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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002649`

染色体: Chr06 坐标: 38280715-38281494 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002649`
名称	SmilChr06G002649
描述	uncharacterized SmilChr06G002649
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38280715 - 38281494 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990879`
GeneID	`130990879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990879`
原始查询	`SmilChr06G002649`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA ligase-like protein, putative (DUF1645) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843378]; symbol=AT1G70420; hit=AT1G70420; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DNA ligase-like protein, putative (DUF1645) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843378]; symbol=AT1G70420; hit=AT1G70420; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G70420` (AT1G70420) DNA ligase-like protein, putative (DUF1645) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843378] identity=36.8; qcov=0.892; evalue=3.49e-37; confidence=medium
Rice	`Os05g0568600` - identity=34.6; qcov=0.927; evalue=7.72e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07816 (DUF1645)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771088.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771088.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057771088.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771088.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771088.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38280937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,C54,C66,C78
`Chr6:38280945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,C54,C66,C78
`Chr6:38280949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C66
`Chr6:38281045`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B119,B23,C40,D11
`Chr6:38281045`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B119,B23,C40,D11
`Chr6:38281046`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B119,B23,C40,D11
`Chr6:38281046`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B119,B23,C40,D11
`Chr6:38281059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B23,C40,D11
`Chr6:38281074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B23,C40,D11
`Chr6:38281119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B23,D11
`Chr6:38281137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B23,D11
`Chr6:38281149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771088.1

259 aa

130

259

DUF1645

PF07816 DUF1645 61-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771088.1`	Pfam	`PF07816`	DUF1645	Family	61	237	1.5e-28	101.4	Protein of unknown function (DUF1645)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915105.1
ATGGATAACAGGCTAAACAGCAGAGAAGATGCATATACGAGCCCTAGCTTCAACAGCTATTCATCCGATAGATTAGCCGAACTCGCCGTTCAAATCTCCGCGGAGAAGAGCGGAGACGACAACGAAGAAGACGAAGATTTCGAATTCTCTCTGGTGCGCGAGGATTTCAAGGAGTTTTCAGCCGAGGATTTCGTCTACGACGGCAAGCTCGGCCCGATCTTTCCGGTGTTCAACCGCGATCTCCTGCTGCGCGACGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990879
ATGGATAACAGGCTAAACAGCAGAGAAGATGCATATACGAGCCCTAGCTTCAACAGCTATTCATCCGATAGATTAGCCGAACTCGCCGTTCAAATCTCCGCGGAGAAGAGCGGAGACGACAACGAAGAAGACGAAGATTTCGAATTCTCTCTGGTGCGCGAGGATTTCAAGGAGTTTTCAGCCGAGGATTTCGTCTACGACGGCAAGCTCGGCCCGATCTTTCCGGTGTTCAACCGCGATCTCCTGCTGCGCGACGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771088.1
MDNRLNSREDAYTSPSFNSYSSDRLAELAVQISAEKSGDDNEEDEDFEFSLVREDFKEFSAEDFVYDGKLGPIFPVFNRDLLLRDGGGDDQSESSIQVPLSQLLLEDRGSGNDNPPSCSSSEADELESVPAGTYCVWRPKASDLRSPSRCKKSKSTGSASKRWKFRDLMRRSNSDGKDSLVFLTPKNREEKLPAEIPKKLKGKGGSSSGAAARSAHEALYVRNRAMNEVDRKKSYLPYRQDLVGFFINVNALGKGLPHF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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