当前解析结果
SmilChr06G002662| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002662 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002662 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002662 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 38467070 - 38467586 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990882 |
|---|---|
| GeneID | 130990882 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990882 |
| 原始查询 | SmilChr06G002662 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990882 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057771092.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057771092.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771092.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771092.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771092.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:38467075 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,C40,C61 |
Chr6:38467101 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr6:38467102 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr6:38467108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,C72 |
Chr6:38467195 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 25 | A11,A15,A19,A4,B127,B132,B24,B40,B41,B5,B58,B59,B6,B66,B71,B89,C10,C20,C21,C36,C62,C67,C85,D11,D3 |
Chr6:38467214 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A25,C32,C48,C68 |
Chr6:38467215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr6:38467253 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,C33,C87,C9 |
Chr6:38467255 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B82,C12,C7 |
Chr6:38467277 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B48,B90,B92,B98,C21,C33,C44 |
Chr6:38467288 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B100,B62,C25,C66,C87 |
Chr6:38467288 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B62,C25,C66,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。