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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002668`

染色体: Chr06 坐标: 38592711-38595911 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002668`
名称	SmilChr06G002668
描述	RNA exonuclease 4-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38592711 - 38595911 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989421`
GeneID	`130989421`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989421`
原始查询	`SmilChr06G002668`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA exonuclease 4-like
产物	RNA exonuclease 4-like
Arabidopsis	`AT3G27970` (AT3G27970) Exonuclease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822421] identity=71.6; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0709000` - identity=65.9; qcov=0.991; evalue=3.88e-167; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00929 (RNase_T)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989421

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769406.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769406.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057769406.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057769406.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38593744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:38593751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:38593758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:38593848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:38594349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr6:38594656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:38594665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B35,D1
`Chr6:38594705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D7
`Chr6:38595355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D7
`Chr6:38595690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769406.1

343 aa

172

343

RNase_T

PF00929 RNase_T 146-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769406.1`	Pfam	`PF00929`	RNase_T	Domain	146	285	3.3e-06	28.4	Exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913423.1
ATTTGACAGCATATATTATCATCTCAACTCAAGTTAACATGCTCCTTGCTTATACAGAGAGAGAGAGAGTGAGATGCCCTGAGATATGGTAACTGCAGGAAATATTCTAGCAGCTAAAAATGTGGGCCACAGAGCATTTGGATTGCCACGAATGTTTTTTTCTTGCTGAAACAGCAGGTGAATTCTAGAGAAAATGACACATTTTCATGCGACCAATGAAGGTGACGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCATATATAAATAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989421
ATGGACAACAGGAACAAATGTGCAGCCTGCTACAGGCAGTTCAATAAGATGGAACATCTTGTTGAACATATGAGGATTTCATATCACTCAAATCATGAACCCCTTTGTGGAATCTGCCACAAGCATTGTCGCTCTTTTGAATCTCTCAGAGAGCATCTCATAGGACCTTTGCCTAAAGCAGAATGCGAGAGGATATTCAAGGAACGAGGATGTGACATATGCTTGAATATTTTCAGCAGCCGCTACGCTCTTCAGCACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769406.1
MDNRNKCAACYRQFNKMEHLVEHMRISYHSNHEPLCGICHKHCRSFESLREHLIGPLPKAECERIFKERGCDICLNIFSSRYALQHHRDKCQFSRGNNGILYRMANLGIQDDLRIDNSRGKVVSLACKMVGGGCDGSLDLCARVCLLDENEKVIFHTYVKPNLPVTNYRYETTGIRAEYLRDATPVRQVGRKIQDYLCNGEPIWQIRSRSGKARILVGHGLDHDLKCLEVEYPEFLIRDTAKYPPLMKTSKLSNSLKYLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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